王陽明在平定漳南匪患以後，開始著力於軍隊組織架構的改革。他曾說：
“習戰之方，莫要於行伍。治眾之法，莫先於分數。”
正德十二年（1517年）五月，王陽明發布軍隊組織改革法案，內容大致如下：
每二十五人編為一伍，伍有小甲。五十人為一隊，隊有總甲。二百人
為一哨，哨有長，有協哨二人。四百人為一營，營有官，有參謀二人。一千二百人為一陣，陣有偏將。二千四百人為一軍，軍有副將、偏將無定員，臨事而設。小甲於各伍之中選才力優者為之，總甲於小甲之中選才力優者為之，哨長於千百戶義官之中選材識優者為之。副將得以罰偏將，偏將得以罰營官，營官得以罰哨長，哨長得以罰總甲，總甲得以罰小甲，小甲得以罰伍眾。務使上下相維，大小相承，如身之使臂，臂之使指，自然舉動齊一，治眾如寡，庶幾有製之兵矣。編選既定，仍每五人給一牌，備列同伍二十五人姓名，使之連絡習熟，謂之伍符。每隊各置兩牌，編立字號，一付總甲，一藏本院，謂之隊符。每哨各置兩牌，編立字號，一付哨長，一藏本院，謂之哨符，每營各置兩牌，編立字號，一付營官，一藏本院，謂之營符。凡遇征調發符，比號而行，以防奸偽。其諸緝養訓練之方，旗鼓進退之節，務濟實用行之。