李顯被廢，李旦成為萬眾矚目的焦點，他承載著李唐王室的希望還有裴炎集團的夢想登上了帝王寶座。可是好景不長，武則天將李旦幽禁起來，沒有重大場合不讓李旦與大臣見麵。
武則天將李旦幽禁之後，迅速進行改製。首先提拔了武氏家族的成員，武承嗣進入宰相集團，牽製了裴炎的權力。武三思又任兵部尚書，控製了軍隊權力。裴炎集團勢力大受限製，裴炎無法再左右武則天。武則天緊接著改元為光宅，並且將東都洛陽改為了神都洛陽。據《舊唐書·睿宗傳》記載：“嗣聖元年，則天臨朝，廢中宗為廬陵王，立豫王為皇帝，仍臨朝稱製。”
武則天的臨朝稱製讓裴炎集團大失所望，裴炎意識到自己才是武則天手中的旗子，可是大局已定，裴炎懊悔不已。裴炎與武則天的關係再次變得微妙，而臨朝稱製將武則天和裴炎的關係送到了絕境。對於武則天來說，現在權力的爭鋒已經存在於自己和裴炎之間，為了限製裴炎，武承嗣上書武則天，對武氏祖宗進行追封，建立武氏七廟。古代，隻有皇帝才可以為祖宗建設七廟，這種做法引起了朝廷和裴炎的不滿。而武則天卻一意孤行，不但建了七廟，還將武氏家族男人封王，女人封王妃。這種大肆分封權力地位的做法，也是在聚攏武氏家族的力量。朝廷大臣雖有不滿，可也隻敢私下議論。唯獨裴炎上書武則天，阻礙武則天追王稱立七廟的事情。“時太後侄武承嗣請立武氏七廟及追王父祖，太後將許之。炎進諫曰：‘皇太後天下之母，聖德臨朝，當存至公，不宜追王祖禰，以示自私。且獨不見呂氏之敗乎？臣恐後之視今，亦猶今之視昔。’太後曰：‘呂氏之王，權在生人；今者追尊，事歸前代。存歿殊跡，豈可同日而言？’炎曰：‘蔓草難圖，漸不可長。殷鑒未遠，當絕其源。’太後不悅而止。”——《舊唐書·裴炎傳》。裴炎用呂後的禍敗之事告誡武則天不可臨朝稱製，不可立七廟越規矩。武則天非常不痛快，但依然照做。裴炎與武則天的矛盾徹底被激化，兩人的合作也徹底終止。從合作共謀的關係，變成了敵對關係。