等到大借款的所有合約、簽字等手續完全告竣後，袁總統才提交參、眾兩議院，請他們備案。兩院議員對此很驚異。參議院中國民黨聲勢最盛，專防袁政府違法擅行，見到此案，不等開會商議，他們便複谘政府：“大借款合同未經臨時參議院議決，違法簽字，當然無效。”眾議院於五月五日開會質問政府，請求解釋。當時，國務總理趙秉鈞因宋案被列為嫌疑，大借款又簽字，自然在國會備受攻擊，便於五月一日辭職，前往天津。袁總統也知道他的意思，便給他假期，暫令段祺瑞代理國務總理一職。
段祺瑞任陸軍總長，本與外交、財政互不幹涉，不過既已代任國務總理，就得出席答複。眾議員當麵責問，段說：“財政拮據，無計可施，不得已變通辦理，還請諸君原諒！”各議員嘩然道：“我等並非反對借款，實反對政府違法簽約，政府如果可以擅行，何需議院！何需我等！”段不便強辯，隻好淡淡地答道：“交議手續確實不夠完備，財政的情形也實在困難，在借款問題上，鄙人以前不知道，諸君不要怪我。如可通融辦理，也是諸君的美意，鄙人無話可說。”說完便走了。眾議員聚議紛紜，有的說應退還谘文，有的說應彈劾政府。那一小半擁護政府的，則不發一言。當下由眾議院議長湯化龍提出投票表決是否承認此借款合同，結果是二百一十九張不承認票，五十三張承認票，因此決議不承認這大借款，準備將谘文退還。
然而，由於統一黨為政府私黨，便在此時暗替政府操作，與共和、民主兩黨密商數次，並用金錢買通兩黨。果然，有錢可使鬼推磨。兩黨得了若幹好處後，便閉口無言，沒有異議。並且與統一黨合並為一，統稱為進步黨。而國民黨議員始終不受籠絡，再三爭執。進步黨人索性遊玩都市，流連花酒，將國事撇諸腦後。國會中出席人數屢不過半，隻好關門閉會，大借款案也暫且擱置。