章太炎初抵台北，即到《台灣日日新報》任職。1898年12月7日該報“社員添聘”稱：“此次本社添聘浙江文士章炳麟字枚叔，經於一昨日從上海買棹安抵台灣，現已入社整頓寓廬矣。”自此至1899年6月，章太炎在台灣寫了大量詩文[2]，絕大多數發表在《台灣日日新報》，此報原是當時台灣總督兒玉源太郎、民政長官後藤新平為控製台灣輿論而設。章氏詩文，大都有政治內容，今先將篇目表列於下：
續表
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章太炎留居台灣期間的詩文，根據目前掌握的史料，除個別篇目，如《儒術真論》載《清議報》[3]，《照井氏遺書》[4]《拙存園叢稿》[5]輯存詩文、附誌，以及修訂《訄書》[6]外，幾乎都發表在《台灣日日新報》上。他赴台即住該報社，離台的當天，報上還登章氏的詩。那麽，研究章太炎在台灣期間的活動，《台灣日日新報》無疑是一份極為重要的資料。
章太炎為何在《台灣日日新報》任事不久，就離職赴日？有人說是為了章氏在報上“抨擊日本官僚擅作威福，壓製台人”，該報社長守屋善兵衛受到都督府斥責後，“令工人去喚太炎，太炎不理他，寫一張條子，令該工人送交守屋。書曰：‘何不喚守屋來？他不知士前有慕勢，王前為趨士者乎？’守屋忍無可忍，親到太炎處咆哮一場，責他‘傲慢無禮’‘不解事理’。並下逐客令曰：‘如果你不願在本館操觚，就辭職歸去吧。’太炎於守屋去後，安靜的自語著：‘名善兵衛，竟是惡兵衛，禮貌衰，則去之，何用逐？’於是經過數日，有便輪出口赴滬，遂攜夫人回去”[7]。據稱這段見聞得自兩名中文記者，似有所據。至於說“便輪出口赴滬”，則不確，因章太炎是“發自基隆”，直抵神戶的[8]。
應該指出的是，從《台灣日日新報》看來，章太炎的詩文，並未發現如上述“抨擊日本官僚擅作威福”雲雲，而主要是指斥以慈禧為首的清政府。這時，清政府正電寄李盛鐸在日本緝拿康有為[9]，又向日本政府交涉，不準康有為留日。康有為遂於1899年4月3日（二月二十三日）自橫濱乘和泉丸渡太平洋。《台灣日日新報》在5月以後，就不見章太炎的論文，隻有幾首和詩，可見章太炎為該報不容，主要是為了他的論文同情康、梁，同情變法，而對慈禧太後為首的清政府則表示不滿。