第二次請願被拒，令一部分人心灰意冷。代表沈縵雲目睹朝政腐敗，不可挽救，感到“天意難回，人事已盡，請自此辭，乃束裝返滬。”[1]他認為中國前途舍革命以外別無他法，思想逐漸轉向革命，當年加入同盟會，成為上海商界上層加入同盟會的第一人。
但大多數人還是懷著一片真誠的愛國熱忱，繼續進行堅忍不拔的鬥爭。
自第二次上書以後，代表團連日接到各省各團體電文四五十件之多，其大旨皆謂，如此次請願無效，各代表萬不可離開都中，各省當速加舉代表數百人來京，為第三次之請願。其中有一電雲：“如政府中有阻撓朝政，熒惑聖聽，而反對速開國會者，當合全國民力，指名抨擊。”[2]
請願被拒的次日，即6月28日，直隸的請願同誌會就開會籌議進行方法，致電代表團雲：“請願二次被駁，人心悲慨，即刻聯合進行，乞堅持勿懈。”同時致電上海《時報》，請轉告各省同誌迅速進行。[3]旋再電請代表團通告各省同誌會，以圖再舉。同誌會幹事及請願代表穀芝瑞、張銘勳、溫世霖、杜寶楨、王觀保立即進京，與代表團協商。
奉天谘議局致電代表團和本省請願代表：“二次請願未準，趁各代表未歸，乞力持上第三次請願書，為民請命，勿懈。”[4]東三省谘議局向總督錫良呈遞了請代奏速開國會書，錫良已允代奏，因朝廷拒絕第二次請願未發。
湖北漢口同誌會在請願書呈送都察院之後，張國溶等一千餘人即致電軍機大臣說：“各界恐慌，上下交困，非速開國會，不足以救危亡。第二次請願書已上，懇極力主持。”[5]請願被拒後，該同誌會又致電代表團：“二次請願已奉旨，惟請願本旨非徒國會虛名，誠以國會不開，決無實效。若財政能整理，籌備一切能完全，則國會永遠不開，已足強國，何須冒犯請瀆。況各國國會均係立法機關，國家諸事何一不當有法律，即何一非國會所當參預。財政困難，民不聊生，前途阻礙，正坐無國會為宵旰分憂故。資政院雖為預備基礎，實無議院精神。外強益促，人心不靖，遵旨不言，殊負國家。擬請通電各省，征合全國人民意思，為三續請願。苟裨國是，他靡所惜，同人謹當執鞭以從。”[6]