前麵對司馬遷撰述《太史公》之目的頗已論述。不過，《太史公》之完成，除了滿足司馬遷本人的意旨之外，作為新學術本身，是否即有足以支持其自主存在之憑借與目的？按：《自序》最後雲：“略以拾遺補藝，成一家之言，厥協六經異傳，整齊百家雜語。藏之名山，副在京師，俟後世聖人君子。”《集解》雲：“遷言以所撰取協於經、異傳、百家之說耳，謙不敢比經藝也。”甚是。蓋百家用史立說，然孔子既歿，仲尼弟子已人人異端，戰國以來諸子門徒更各自異說，所述之曆史問題需要考論真相而整齊之，始能還原重建曆史，據以廓清其訛，判斷其說。司馬遷此統一與重建曆史之目的，原本就是順著其父“所欲論著”的意旨而來，執此以言，司馬遷賦予《史記》之學術目的，是要它成為一部天下史文之匯宗，集諸子百家說法而折中統一之，俾能作最後取則依歸的學術。司馬談遺囑謂孔子修六藝，“學者至今則之”。司馬遷為孔子作世家，傳末伸其景仰之心，推崇地說：“孔子布衣，傳十餘世，學者宗之，自天子、王、侯，中國言六藝者，折中於夫子。可謂至聖矣！”[23]天下言六藝者折中於孔子，《史記》成，則天下言古今曆史文化者，將取則於司馬遷，斯所以始有“俟後世聖人君子”的期望。
欲其學術為後世學者取則，此固為《史記》本身的目的之一，但前文所引“成一家之言”之句，實亦蘊含了另一種學術目的。這句話的意義，《報任少卿書》即有說明雲：
仆竊不遜，近自托於無能之辭，罔羅天下放失舊聞，考之行事，稽其成敗興壞之理，凡百三十篇——亦欲以究天人之際，通古今之變，成一家之言。
這段話譯為今語，即：我透過劣拙的文字敘述以重建曆史，其方法曆程，為全麵搜集史料，對事實進行考證，研究及解釋它的發展趨勢和因果關係，完成此一百三十篇的《太史公》書，我也希望透過此書，究極天人的關係，通徹古今的變化，建立自己的一家之言。