宗教的存在具有曆史性，宗教的消亡具有過程性，不能把它理解為短期的行為，也不能把它誇大為永恒的存在。對於宗教消亡問題，要放在思想史的背景中來理解，要從認識發展的規律來體會。
任何一種宗教都不是無緣無故地產生的，任何一種宗教都有其發展的經曆。當今世界上大的宗教派別，基本上都經曆了從小到大的過程。比如，基督教的發展中，最初的教義和形式比較簡單，後來的東西，有不少是希臘羅馬加進去的。“隻是通過一神論的猶太宗教的媒介作用，後來的希臘庸俗哲學的文明的一神論才能夠取得那種唯一使它能吸引群眾的宗教形式。但找到了這樣一種媒介以後，它也隻有在希臘羅馬世界裏，借助於希臘羅馬世界所達到的思想成果而繼續發展並且與之相融合，才能成為世界宗教。”[49]因此一種宗教的形成和發展過程，是不斷適應一些人的思想和心理需要的過程，也是不斷地吸收和借鑒其他文化內容的過程。
首先是宗教的思想根源。馬克思認為：“一切破壞心靈的寧靜、一切引起危險的東西，不可能屬於不可毀滅的和永恒的自然。意識必須明白，這是一條絕對的規律。”[50]因此，實現人的解放與實現宗教消亡是一致的。這一目標不是靠幻想或假說來實現的，也不能靠“同現實的影子”進行哲學鬥爭來實現，青年黑格爾哲學主張的“隻要我們教會他們如何用符合人的本質的思想來代替這些幻想”、“隻要我們教會他們如何批判地對待這些幻想”、“隻要我們教會他們如何從頭腦裏拋棄掉這些幻想”，就能實現人的解放，無異於癡人說夢。宗教源於思想認識問題，拿原始宗教來說，人們不知道大自然為什麽會有風雨雷電、陰晴圓缺、白天黑夜、四時交替以及生老病死，於是就想象有一種神秘的不可抗拒的力量在支配著世界，進而產生神靈崇拜、圖騰崇拜、生殖崇拜等。這種基於對自然認識缺乏深刻認識基礎上的思想意識，隻有在不斷提高覺悟中才能得到糾正。這一方麵說明了科學方法在消滅宗教中的重要性，另一方麵也預見了宗教存在的複雜性和頑固性。在處理同宗教的關係時，避免出現傷害宗教感情的事情，這也是解決思想問題的重要方麵。在人與神顛倒的世界中，一切偉大的、美好的、真正人性的事物都被歸諸神，曆史充滿神性、非人性和獸性，解決宗教消亡的思想根源問題，“應當通過宣傳、通過教育來進行鬥爭。鬥爭過激會引起群眾的憤恨；這樣進行鬥爭會加深群眾因宗教信仰而造成的分裂，而我們的力量在於團結”[51]。在這裏，列寧看到了鬥爭可能引起的宗教矛盾，由此造成的群眾分裂和力量分散無疑是革命內能的巨大減損，因此這種鬥爭應該是適度的有理、有利、有節的鬥爭。在當時的德國哲學看來，“人隻須認識自身，使自己成為衡量一切生活關係的尺度，按照自己的本質去評價這些關係，根據人的本性的要求，真正依照人的方式來安排世界，這樣，他就會解開現代的謎語了”[52]。但在實際上，人所固有的本質比主觀臆想的“神”的本質高尚得多，真正的複歸不是歸於“神”而是歸於“人”，這是宗教消亡中的思想解蔽過程。