關於清代台灣的宗族組織，前人已經作了不少研究。在此主要依據台灣學者的有關研究成果，並結合筆者所見曆史資料，概述清代台灣宗族組織的發展進程。
大陸移民大批渡海入台，始於鄭成功收複台灣之際，當時隨鄭氏入台的軍民有6萬人左右。至康熙統一台灣時，當地的漢人總數約為12萬人。不過，由於清廷一度對台灣的棄留舉棋不定，當地漢人“年年回歸泉州、漳州、廈門等地”,留居台灣的人數急劇減少。康熙二十七年間，台灣島上“僅有漢人數千名居住”L168I。在此情況下，自然很難形成穩定的宗族組織。康熙中葉以後，台灣政治地位已定，大陸人民又紛紛移居台灣，至使當地人口迅速增長。乾隆後期，台灣人口已超過100萬；嘉慶年間，接近200萬；光緒十七年，高達254萬。L1691隨著人口的持續增長和漢族社區的不斷擴大，大陸固有的宗族組織逐漸得以重建和發展。
清代台灣雖是新開發的移民地區，同族聚居的現象仍是相當普遍的。這是因為，在大陸移民渡台之初，為了協同應付複雜的社會生態環境，往往是同鄉同族結伴而行，或是先後渡台的同鄉同族相互援引，因而從一開始即已形成同鄉同族相對集中的趨勢。清中葉以後，在一些開發較早的地區，不同祖籍及族姓的移民之間經常發生“分類”械鬥，勢力較弱的一方往往被迫遷徙到同鄉同族人數較多的地區，這就進一步促成了同族聚居規模的擴大。根據陳紹馨和傅瑞德對1956年台灣戶口資料的抽樣統計，各地都有不少人口占明顯優勢的大姓。陳其南以主要二姓占鄉鎮人口40%以上為指標，進一步驗證了台灣各地族姓分布的集中趨勢。
表中資料表明，在福建漳州、泉州二府移民聚居的地區，姓氏集中的現象相當突出，而在廣東移民的聚居地，此類現象尚不明顯。不過，由於該項統計是以鄉鎮為單位的，還不足以充分反映同族聚居形態。如果是以村莊一級的自然聚落為單位加以驗證，同族聚居的現象勢必更為突出。另一方麵，有些大姓的聚居範圍，往往包含若幹村落，甚至是超鄉鎮的。如彰化平原，“大村鄉的中部有七八個村落是祖籍漳州府平和縣心田鄉賴姓宗族聚居之區。埔心鄉和員林鎮一帶則分別為祖籍廣東潮州府饒平縣的黃姓和張姓分布區。員林鎮東南和社頭鄉東北角一帶，從柴頭林到龍井村之間的四個村落是漳州府南靖縣施洋枋頭劉姓宗族分布區。社頭以南，田中鎮以北則為漳州府南靖縣書洋肖氏分布區。田中以南到二水之間為漳州府漳浦縣陳氏一族分布區”1711。彰化平原的這種同族聚居規模，即使與閩東南沿海相比，也是毫不遜色的。