清初實行遷界的目的，是為了對鄭成功的抗清據點實行經濟封鎖，企圖切斷鄭氏集團與內地的聯係。早在順治十七年間，已在靠近廈門的同安縣和海澄縣實行小規模的遷界，沿海八十八堡居民被迫遷往內地。順治十八年，又以江、浙、閩、粵沿海“逼近賊巢”為由，盡令遷移內地。福建沿海於康熙元年全麵實施遷界，至康熙八年實行局部展界，康熙十九年後全麵複界。1931康熙二十二年的複界特使杜臻，詳細記述了福建沿海的遷界範圍及遷荒頃數。
凡加“*”者為“入海”,即地處半島，其餘為“附海”,即地處內陸。由於福建沿海地形複雜，半島甚多，因而實施遷界的範圍也較大。根據清人有關記述，實施遷界的地區一般隻限於沿海30裏以內,而福建各地劃定的“邊界”,離界外村鎮大多超過了30裏，最遠者竟有90裏之遙。應當指出，上表列舉的界外村鎮，隻是界外地區的少數最主要聚落，而不包括所有的界外村鎮。例如，莆田縣被劃為界外的共有700餘村,而上表中僅列舉6處。此外，根據朱維幹先生的考證，杜臻所記錄的遷荒頃數，實為康熙八年實施局部展界後的遷荒數，若據福建地方誌中的有關記載，最初的遷荒數應為3萬餘頃，而非杜臻所記錄的2萬餘頃。
清初強迫沿海居民遷往內地的做法，是極為殘酷的。《榕城紀聞》記雲：“令下即日，挈妻負子，載道露處，放火燒屋。……部院派往海邊燒屋，計用長夫一千三百名。”《莆變紀事》記雲：“刻其十日內不遷，差兵**剿。……當播遷之後，大起民夫，以將官統之出境。毀屋撤牆，民有壓死者。”清廷在下令遷界之後，曾諭告各省督撫“迅速安插遷民，酌給田園房屋”198l,而實際上並未付諸實行。福清人薛熔在《桐林族譜序》中記雲：“壬寅奉令內徙，火海濱廬墟之，聽民自裹糧，挈男女老羸，惟所之而止。既不若賈讓所言，出數千年治河之費以業所徙之民，又不若元封時徙東甌閩越處以江淮之地，業與地兩無所資。蹩蹙死亡之餘，散依遠近各鄉，若外都邑及楚豫吳越，有相去千裏而遙者。”1991在此情況下，被劃為界外的聚居宗族無不土崩瓦解，流離失所。例如， 《詔安蒲氏家譜》記載：“清初鄭國姓憑海為巢穴，本朝以遷界絕其交接。宗族居址皆屬海濱地方，是以流離逃散，所有墳墓、木主盡失落焉。”1001《銅山南嶼陳氏族譜》記雲：“國朝康熙三年甲辰，銅被遷移，西平藩統大兵至銅山勒遷，推城焚屋，居民逃竄，慘甚不堪。祖祠焚毀，屋舍丘墟，而墳墓亦複淒然。族人分散各處，不可勝紀。”[101海澄縣《圭海許氏世譜》記雲：“康熙元年壬寅，禁嚴接濟，朝議移界以絕交通，棄政橋以東為界外，遂使田裏就蕪，族姓鴻嗷中澤，而棲神祠宇竟銷毀於金戈鐵馬之健兒矣。”[1021同安縣《集美陳氏族譜》記雲：“清朝康熙二年，被大兵進剿，闔族裔孫數千口，失散越國者，不知去向。”晉江縣《東石汾陽郭氏族譜》記雲：“順治庚子十七年，兵燹、遷都，門庭鞠為茂草，堂階盡屬穢蕪，父子兄弟流離失所，族譜一盡失落。”[1041莆田縣《錦南蔡氏世譜》記雲：“丙戌清明鼎革，中間治亂頻仍，越辛醜濱海遷移，故園禾黍。既遷而複，複而又遷，將二十餘年。子姓流離，不可名狀，遑計及家乘乎?”11051至複界時，各族人口已大為減少，祠堂、祖厝、祖墓、族譜等已喪失殆盡，原來的宗族組織已完全解體，因而必須重新組建。