國內通論性的晚清史學術研究始於1912年清亡之後，並分別被納入兩個不同的學科之下：一是作為斷代史清史研究的一個組成部分；二是作為中國近代史研究的一個組成部分。
在斷代史清史研究學科體係之下，這一時期的晚清史研究，大致又可分三個流派。一派為清朝遺老派，以《清史稿》為代表。他們站在遜清的立場上，於1914年開始編纂，借修史報答先朝皇恩，在內容選擇和措辭上多方為清朝歌功頌德，如在撰修過程中，對於清朝統治者的殘暴行徑，以及有損清室帝王尊嚴、後妃名譽的事件，或避而不談，或輕描淡寫；而在忠義、列女等傳的安排上，則不惜篇幅，褒揚鋪張；在撰修帝紀中，對清朝皇帝也多溢美之辭，"至勤""至明""至仁"等詞處處可見，並不惜違背傳統斷代史修史體例，為許多生於清而死於民國的忠於清朝的遺民立傳。另一方麵，《清史稿》對清代的反清革命活動則盡量少寫，甚至不寫，如對興中會、同盟會的建立、民報的出版以及孫中山領導的許多次武裝起義，《清史稿》全都沒有記載；孫中山作為推翻清朝統治的領袖，《清史稿》僅在光緒三十年五月慈禧太後下旨赦免戊戌黨人時一見其名，將他與康、梁二人一道被列入大逆不赦之人。同樣，對於存在14年之久的太平天國政權，《清史稿》也不按傳統修史慣例，設《載記》以記其事，僅設《洪秀全傳》,草率應付。並且，凡是記載反清活動，《清史稿》都以“倡亂”“謀亂”“謀逆”等詞稱之，等等。《清史稿》這種“內清而外民國”的修纂立場，直接反映遜清遺民對民國正統地位的拒斥心理，結果於1929年12月遭南京國民政府封禁。
另一派為民族革命派，以許國英、汪榮寶合撰和合編的《清史講義》和《清鑒易知錄》,劉法曾的《清史纂要》,黃鴻壽編的《清史紀事本末》,陳懷的《清史要略》,蕭一山的《清代通史》等為代表。這一派的學者與清朝遺老派相對立，他們秉承民族革命史觀，奉民國為正統，將清朝統治看作異族統治，多加抨擊和批判，認為清朝的曆史，是清朝入主中原統治中國的曆史，同時也是以漢族為主的中國民族革命的曆史，清朝的滅亡都是由民族壓迫和專製統治所致，他們對清代的反清革命活動都做正麵論述和評價。