關於男女兩性的認識，盧梭提出了三個基本觀點：第一，男人和女人共同的地方在於他們都具有人類的特點，他們不同的地方在於他們的性別。就他們共同的地方來說，他們是相等的；就他們不同的地方來說，是無法比較的。
第二，在兩性的結合中，每一種性別的人都同樣為共同的目的而貢獻其力量，不過貢獻的方式是不同的，因此，兩性在精神上也會有明顯的差別。男性一般比較積極主動、身強力壯，而女性則顯得消極被動、身體柔弱；男性必須具有意誌和力量，而女性隻要稍微有一點抵抗的能力就行了。不僅如此，盧梭還認為，“女人是特地為了使男人感到喜悅而生成這個樣子的”①。第三，較強的一方在表麵上好像是居於主動，而實際上是要受較弱的一方的支配的。他說：“女人管束男人的方法是用溫情去管束，是用巧妙的手腕和殷勤的態度去管束；她是采取關心男人的方式去命令男人做事的，她是采取哭泣的方式去嚇唬男人的。”②基於這種認識，盧梭特別反對把女人看做是不完全的男人的主張，認為這種看法是完全錯誤的。
此外，盧梭還認為，男女兩性不僅在身體、性情等方麵有差異，他們在智力發展上也有差異。在他看來，男女身心發展的速度和程度是有很大差異的。他認為女性的語言能力和判斷力的發展比男性要早，但是，她的理性發展所能夠達到的程度卻很有限。
按照盧梭自然教育的思想，“如果你想永遠按照正確的道路前進，你就要始終遵循大自然的指導。所有男女兩性的特征，都應當看做是由於自然的安排而加以尊重。”③因此，在論證了男人和女人在體格和性情上不是而且也不應當是完全相同之後，盧梭便得出結論說：“他們所受的教育也必須有所不同。”④他們固然應當遵循自然的教訓，在行動上互相配合，但是他們不應當兩者都做同樣的事情；他們工作的目的是相同的，但是他們工作的內容卻不一樣，因此促使他們進行工作的情趣也有所差異。所以，他告誡說：“賢明的母親，請你相信我所說的這一番話，不要違反自然把你的女兒造就成一個好男子；你應當把她培養成一個好女人，這樣，對她自己和對我們都有更大的好處。”①