基因組到底是什麽
有多少讀者聽說過“基因組”這個詞呢?
我想,應該比聽說過“基因”的人要少一些吧。基因組指的是生物體所有遺傳物質的總和,大家把它理解成一整套的基因就可以了。
基因組(genome)這個詞,是基因(gene)加上希臘語中表示“全部、完整”(-ome)的詞綴組成的合成詞。我以為,“研究對象+ome”合成的詞語,在自然科學的學科當中,也隻有生物學有此創想。
這可以說是一種“網羅主義”的思維方式。與之相對的,我想應該就是物理學的“原教旨主義”。簡而言之,在研究同一種自然現象時,物理學等學科崇尚普遍的理論或者原理,並追求建立模型。
生物學當然也會追求普遍的規律。但對規律的追求都是暫時的,往往會追加許多例外情況,從整體、全麵的角度去考慮。換言之,物理學是從種種現象中排除多餘的事物,摸索出普遍的原理。而生物學則是在普遍的原理的基礎上,發現多種多樣的現象,在研究過程中不斷將規律的範圍擴大。
最近,人們對所有轉錄產物(transcript)的集合—轉錄組(DNA轉錄得到的所有RNA)、所有蛋白質(protein)的集合蛋白質組(翻譯出的所有蛋白質)越來越關注。而這些研究的源頭,都來自試圖研究所有遺傳物質的基因組研究法。
因此,人們開始對各種生物開展名為“基因組計劃”(Genome Project)的研究嚐試。但準確地說,基因組計劃其實是分析所有作為基因本體的染色體DNA的核酸序列,而並非分析所有的基因,也就是真正意義上的基因組。基因組計劃歸根結底隻是在為分析基因組分析做準備(一種極其重要的準備)。
在這一驅使下開啟的基因組計劃之一,正是“人類基因組計劃”。人類基因組計劃,是於1990年在美國的主導下啟動的。初始的預算是30億美元,計劃開展15年。但隨著過程中計劃推進速度加快,大致的序列分析(被稱作“測序草圖”)在2000年就完成了。