厚黑學認為，管人的關鍵是管心，一個國家的思想主要出自知識分子階層，管住了他們就等於管住了國家的“心髒”。
心亂則國亂，心定則國安。縱觀曆朝曆代，最先謀反的就是知識分子，最想有所作為的也是知識分子。雖然最後改朝換代的人都是武將，但“禍根”一般是知識分子種下的。
明朝建立後，統治階級內部的矛盾逐漸顯露，除了統治階級內部淮西集團和非淮西集團的黨爭，文人與新朝的矛盾也是很突出的。朱元璋在多年的征戰生涯中深知知識分子的厲害，他最怕文人攪亂社會，發表對新朝不利的言論。
朱元璋稱帝之後，在地主階級文人中，有少數文人儒士對由紅巾軍發跡的朱元璋抱有敵意，對這位“和尚天子”也看不起，他們拒絕與新王朝合作。於是謝絕新王朝的征召，朱元璋對這些不肯合作的封建文人毫不客氣，需要時一個詔令就把他們叫過來，不幹也不行，你不來，就是對聖朝抱有敵意。
例如：洪武初年，朱元璋召見元朝最後一位衍聖公，孔子第五十五代孫孔克堅入京朝見。孔克堅因為有病，沒有立即赴京，而是派他的兒子孔希學代自己入京，先行朝見朱元璋。朱元璋馬上想到孔克堅是瞧不起自己布衣出身，於是又派人送去一封親筆諭旨，指出：“我雖是庶民出身，但古人由布衣平民稱帝的前有漢高祖，你憑什麽看不起我？”又指出，孔克堅無病裝病，不入京朝見，是怠慢無禮。諭旨一到，孔克堅嚇壞了，哪裏還敢停留，立即動身進京朝見。
但是，朱元璋把文人儒士叫過來之後又不重用。
危素曾做過元朝的參知政事，禮部尚書，主持過宋、遼、金史的編修。明軍攻占了元大都後，危素曾經跳井以殉元朝，被僧人救起沒有死成。後來，明太祖朱元璋授予他翰林侍講學士，弘文館學士，曾經讓危素為自己撰寫《皇陵碑》，朱元璋看後不滿意，棄而不用，自己親自撰寫。朱元璋對這位頗有才華的老儒始終不太信任，心裏總不忘他是元朝舊臣，多次貶低甚至侮辱。有一次，朱元璋正在東閣，危素也來到東閣，朱元璋故意問：“來者何人？”