《春秋董氏學》除“自序”外，正文共八卷，分別為：《春秋旨第一》《春秋例第二》《春秋禮第三》《春秋口說第四》《春秋改製第五》《春秋微言大義第六》（上、下）《傳經表第七》《董子經說第八》。這八卷中，第一、第二、第三、第四、第五、第六各卷，都是康有為摘編董仲舒《春秋繁露》的內容，按照每卷的主題，加上小標題，適當加注按語，闡發他所認為的《春秋》大義。卷七是康有為弟子王覺任根據康有為《公羊》學術觀和傳承觀編製的“傳經表”，卷八是康有為對董仲舒《春秋繁露》若幹內容與《六經》和《論語》等經典關係的點撥（指明出處），以及“訓詁附”。卷一、卷二、卷三、卷四、卷五、卷六，在卷首都有導言，而且在諸多條目下有按語；卷七在卷首有導言，但作為正文的整個“傳經表”內容沒有按語；卷八沒有前麵七卷那樣的卷首導言，而且按語極為簡單，僅僅是對所編列的《春秋繁露》若幹內容出處的點明而已。因此，整部《春秋董氏學》的重點，是在前六卷。
從結構的構思來看，康有為是頗費心思的。卷一談《春秋》的宗旨，卷二談《春秋》的範例（事例）、卷三談《春秋》的禮義，這些都是有現存的文獻做依據的。卷四談所謂“口說”，亦即沒有經典文獻依據，但卻認為是真正的孔子精神、真正的春秋大義的內容。大概由於是“口說”，本卷和卷一、卷二、卷三、卷五、卷六不同，沒有小標題。由於沒有小標題，在表象上似乎與卷七（“傳經表”）和卷八（“董子經說”）相同，實則在內容和性質上有根本不同。這個不同，就是該卷（“口說”）是康有為公羊學思想的重要體現，有很多按語，很多“創見”。卷五談改製，卷六談微言大義。顯然，由宗旨、事例、禮義，到“口說”（實是對《春秋》公羊學的微言大義的闡發），進而“改製”，最後以“微言大義”收束思想論述部分。繼而，開列“傳經表”以凸顯董仲舒公羊學的傳承譜係，實際上也是增強該書的權威性；最後，點明《春秋繁露》裏麵引證、援用的若幹文獻，是出自《六經》某部分，或者出自儒家某部其他經典，不僅彰顯了董仲舒《春秋》公羊學的經典權威性，同時也展示了康有為自身的博學和論學的有據。整個思路，具有明顯的邏輯性，可謂層層遞進，環環相扣。