秦漢時期，是中醫理論體係建立的時期，是中國傳統的“天人合一”哲學臻於完善的時期。前者的代表作是《黃帝內經》[192]，後者的代表作是《春秋繁露》。這時期，“究天人之際”“天人合一”的理論廣為流行。在這種社會思潮和文化氛圍中，在建立中央集權的大一統的封建帝國的曆史要求下，哲學和醫學相結合，借醫學以光大；醫學則納哲學於自身，靠哲學而弘揚。在一係列問題上，表現出共同之處。
首先，《黃帝內經》和《春秋繁露》都貫穿著陰陽五行思想，陰陽五行是二者類分事物進而論證其理論的根據和前提。《黃帝內經》認為，陰陽普遍存在於自然界和人體之中，自然界有陰陽：“天為陽，地為陰；日為陽，月為陰。”[193]“水為陰，火為陽；陽為氣，陰為味。”[194]人以及一切生命體有陰陽：“人生有形，不離陰陽。”[195]“生之本，本於陰陽。”[196]甚至說陰陽“數之可十，推之可百；數之可千，推之可萬”[197]。因此，它利用陰陽五行範疇，綜合人的生理稟賦、道德品質和性格特點，將人分為不同類型。《靈樞·通天》篇認為：“蓋有太陰之人，少陰之人，太陽之人，少陽之人，陰陽和平之人。凡五人者，其態不同，其筋骨氣血各不等。”由於這五類人所稟賦的陰陽氣有所不同，所以具有不同的人格體質，而這不同的人格體質，又各具不同的精神麵貌、道德品質和社會心理。比如，“太陽之人，貪而不仁，下齊湛湛，好內而惡出，心和而不發……少陰之人，小貪而賊心，見人有亡，常若有得，好傷好害。見人有榮，乃反慍怒，心疾而無恩”，等等。《靈樞·陰陽二十五人》篇則依據五行把人分為木、火、土、金、水五類，並將五行分別與五髒相配置，以方位、顏色、聲音相配合。如木與肝髒、膽髒相配合，方位為東，色為蒼，音為角，再根據角音的偏正、多少，分為上角、太角、左角、鈦角、判角五個亞類，每類心理特點也有差異。其他四類依此類推，可推演出五五二十五類人。《黃帝內經》以陰陽五行為分類法則，使複雜的問題簡單化；同時，又使雜亂無章的各種事物和現象規範化，使事物由混沌變為有序，具有方法論的意義。