在馬克思的哲學中，社會有機體理論對社會研究具有重大的方法論意義，或者說，在馬克思的社會研究方法係列中，社會有機體的方法具有特殊意義。正如列寧所說：“馬克思和恩格斯稱之為辯證方法（它與形而上學方法相反）的，不是別的，正是社會學中的科學方法，這個方法把社會看作處在不斷發展中的活的機體。”“辯證方法要我們把社會看作活動著和發展著的活的機體。”[1]我們不能把馬克思的社會有機體理論僅僅看作理論。實際上，方法與理論具有內在的聯係，辯證法既是方法又是理論，唯物主義既是理論又是方法，是“唯物主義方法”。在馬克思哲學中，理論與方法融為一體，深深地根植於新唯物主義的內在本性之中。在馬克思的哲學中，社會有機體理論與社會有機體方法已融為一體，而社會有機體方法實際上就是社會研究中的總體性方法。