根據研究設計的要點，案例研究設計通常包含以下幾個步驟。
（一）形成研究問題
研究者在設計研究之前首先要考慮研究問題是什麽。一般來說，進行案例研究主要試圖回答“怎樣”和“為什麽”等解釋性的問題。另外，問題要與當前在真實環境中發生的事件和行為有關，並且研究者對過程缺乏控製能力。研究的問題可以是來自自己工作實踐中的具體問題，也可以是對理論的反思與驗證和對相關文獻的思考與疑惑。對於教育實踐者而言，許多案例研究問題都來自學校的教學實踐，如教學方案的實施研究、校本課程開發的可行性問題研究、學生學習積極性的問題研究或者教師專業發展的問題研究等。以學生學習積極性的案例研究為例，研究的具體問題可進一步確定為：學生學習積極性狀態是什麽？哪些因素提升學生學習積極性？通過什麽樣的舉措可以激勵學生學習？
（二）案例的抽樣
確定了研究問題以後，案例研究一般采取有目的的抽樣方式，即根據研究目的抽取那些能為研究提供最大信息量的樣本。另外，研究者要思考選擇單案例還是多案例進行研究。多案例研究所得出的結論比單案例研究得出的結論更有說服力，但開展多案例研究需要選取更多的研究對象，投入更多資源和時間，需要研究者根據研究問題與理論去確定。確定了選取單案例或者多案例研究後，便可進行案例的抽樣。根據巴頓（Patton）和王文科等學者的論述，案例研究的抽樣有以下幾個策略。
1.代表性案例抽樣
研究者要考慮研究對象的普遍特征，從符合一般情況的人或事物中，選取有代表性的案例，比如了解中學的課程改革現狀和對策時，可以選取某個推動課程改革力度較大的區，從中選擇近年來課程和教學實驗推廣成效比較顯著的學校，確保案例的顯著性，以期把研究結果推廣，能給其他的案例以啟發。