不出施耐庵所料，洪武皇帝果然開始大肆殺戮功臣，前後有四萬多文臣武將遇害，軍中為之一空，更不允許&qu;兵家秘訣&qu;留在世間。羅貫中暗恨朱元璋殘暴狠毒，立誓讓&qu;兵家秘訣&qu;流傳後世，但朝廷上法度森嚴，明寫兵書無異於自尋死路，況且也沒有書商膽敢出版印製。
羅貫中心生一計，窮其畢生精力，將神妙無比的&qu;兵家秘訣&qu;分解開來，以明朝開國戰例為素材，全部寫入《三國誌通俗演義》，全書借用三國時期複雜的政治軍事鬥爭為背景，起自黃巾起義，終於西晉統一，書中褒劉貶曹，寄托了羅貫中師徒對仁君的向往，以及對奸雄的切齒痛恨。
這部暗藏&qu;兵家秘訣&qu;的《三國誌通俗演義》，終於在嘉靖元年刊印出版，自此膾炙人口，廣為傳播，改編成評書戲曲的段落不計其數，卻一直沒有任何人察覺到被羅貫中隱匿在書中的&qu;軍事密碼&qu;，也正是由於這篇密碼的存在，徹底顛覆了大明王朝的江山社稷。
轉眼間時移物換，到了明朝末年，已是朝綱敗壞，各地流寇蜂起，衝州撞府，勢如席卷，內憂外患接踵而來。
清太祖努爾哈赤起兵攻明，八旗鐵甲橫掃遼東，消息傳到北京，舉國憤慨。大廈將傾的危難關頭，天啟皇帝授袁崇煥山海監軍之職，築寧遠城，憑借壁壘堅固和紅夷大炮，重挫八旗精銳。
袁崇煥認為八旗彪悍，來去如風，十分善於野戰，但攻城戰術有限，北騎尤懼大炮轟擊，一遇堅城重炮便無可奈何，所以明軍應當憑借火器，守而後戰，堅壁固壘，避銳擊惰，相機堵剿，可為取勝之道。他采用這一戰術，先後取得了兩次寧遠大捷，預計數年之內即可收複遼東。
但這時候袁崇煥受到朝中奸黨彈劾，不得不稱病請辭，他回到北京叩見皇帝謝恩，心中不免感慨萬千。返鄉前無意獲悉了一個驚天動地的大秘密，相傳古時有&qu;兵家秘訣&qu;，神鬼不測其機，幽冥難窮其幻，羅貫中臨終前留下一部手書原稿，比坊間刊印書籍，多出了一個關於漢代&qu;傳國玉璽&qu;的古怪謎語，原來真正的&qu;兵家秘訣&qu;，都被他用暗語寫在《三國演義》的字裏行間。後漢三國時期，各路諸侯討伐董卓時，率先攻入洛陽城的孫堅，在井中得一宮女之屍身上有一紅色盒子，匣中之物正是傳國玉璽。之後孫堅之子孫策將玉璽獻與袁術以借兵馬。孫策用此璽從袁術處換來三千兵將，從而奠定了孫吳霸業之基。袁術稱帝失敗後，玉璽歸屬曹操。羅貫中所著《三國演義》中，凡是涉及傳國玉璽的段落，都與他生前留下的謎語有關，謎語的答案即是解讀&qu;兵家秘訣&qu;的方法。此時關外女真與闖賊都在暗中尋找這份手稿。