即便政虎和景定二人已經知曉大熊朝秀、玉蟲貞茂等人的舉兵謀逆是被武田晴信挑唆的，但也不能因此而與武田家正式開戰，在那之前必須想好相應的對策才行。
雖然政虎認為武田晴信的策略必然不止這一些，但是眼下村上義清的兵鋒正盛，隨時都有可能在攻滅高梨家之後攻入越後。故而政虎也在景定、綾姬等人的勸說之下隻能放棄遁入空門的念頭了。
越後上杉家的家臣們除了已經逃亡奧信濃高井郡的大熊朝秀、玉蟲貞茂等人之外都對自己的能力心知肚明，不論是誰都沒有政虎那樣的能力與威望。
在長尾景信、本莊實乃、直江景綱等人的帶頭下，眾家臣們皆齊聚越後府中一帶恭迎政虎重返府中禦館。
就在山本勘助成功調略大熊朝秀、玉蟲貞茂等人於南頸城郡舉兵謀逆後，與此形成呼應的便是武田晴信再次出兵對北信濃展開侵攻。
武田晴信意圖趁著越後上杉家內訌，而無暇顧及北信濃諸郡之際，加速推進對北信濃諸郡的侵攻。
畢竟柿子要撿軟的捏，接連被村上義清擊敗兩次之後的武田晴信痛定思痛後，決定先攻打實力較弱一些的小笠原長時，並以此來積攢更多的實力，好在將來對村上領發起鉗形攻勢。
天文十六年，六月。武田晴信率一萬五千餘大軍攻入了安曇郡，並且在一天之內攻落先前倒向小笠原長時的平瀨城，討取平瀨城城主平瀨下野守以下兩百餘人。
三天之後，武田軍更是趁著大勝之際先後將隸屬於小笠原長時的古廄城、小岩嶽城、刈穀原城、涉田見城等地一一攻落。還討取了古廄盛勝、小岩盛親（小岩嶽盛親）、太田長門守、涉田見盛家等眾多小笠原長時旗下的有力武將。
之後，武田晴信還在無呂原一帶以絕對優勢的兵力擊潰了不足千人的小笠原軍，小笠原長時在無法扭轉敗局之後隻能率殘部退回了中塔城苟延殘喘，小笠原家複興的希望也就此破滅了。