毛澤東不僅在經濟建設上開始探索中國式的道路，在社會主義文化建設上也同樣強調中國特色。1951 年，戲劇界對於中國京劇產生了爭論，有些人過於強調向蘇聯學習，主張發展話劇、芭蕾和歌劇，而對於京劇，主張幹脆取消；而另一些人則走到了另一個極端，認為京劇是中國國粹，應該原汁原味地繼承下來。毛澤東認為，中國和世界的各種戲曲形式都要繼承發展，去其糟粕，取其精華。為此，他給剛剛成立的中國戲曲研究院題詞時寫了八個大字：“百花齊放，推陳出新。”
1953 年，當史學界討論曆史研究的方針，準備出版《曆史研究》雜誌時，毛澤東又讓他的秘書轉達了他的意見，說曆史研究要“百家爭鳴”。
但是，由於新中國成立後在相當一段時間內，向蘇聯學習成了我國社會生活的主旋律，在移植蘇聯模式的時候，也受到蘇聯學術研究中一些不良習氣的影響。一方麵，把蘇聯的學術研究結論當作金科玉律，不敢有絲毫的懷疑；另一方麵，把歐美的學術研究看成是資產階級的，一概加以否定，甚至在自然科學領域也是如此，把政治色彩強加於科學研究上。當時，在生物遺傳學領域，蘇聯的李森科、米丘林學派和美國的摩爾根學派都很流行，有些人就把李森科學派的觀點看作革命的無產階級學說，而將摩爾根學派的觀點視為資產階級腐朽沒落的觀點。在國際上很有影響的我國生物遺傳學家談家楨，一直堅持摩爾根學派的觀點，因而在很長一段時間裏，他遭受著不公正的對待。毛澤東一直對這種給科學研究戴政治帽子的做法不以為然，當他得知談家楨的處境時，立即給這位著的科學家寫信，對他表示支持，鼓勵他繼續研究下去，同時指示有單位，給談家楨創造條件，以便他能更好地進行科學研究。