永曆五年（1651年），鄭成功重新整編了他的軍隊，又另外增了十個營。這十個營就是仁、義、禮、智、信五營和英兵、奇兵、遊兵、殿兵、正兵五營。另外他又著手改善戰鬥武器，命令他的手下陳啟製造單器，使得軍隊的戰鬥力更為強大。此外，在清政府那邊，也有許多人先後投到鄭成功的麾下。這些人是黃興、黃梧、張名振、周雀之、阮駿等，他們都加入到鄭成功反清複明的隊伍中來。鄭成功在幾次戰鬥中都有取得了輝煌的戰績。
當年五月，鄭成功再度和清政府的將領王邦俊相遇，在海澄附近進行了激戰。王邦俊深知鄭成功的厲害，因此他調了好幾千人來壯大聲勢，但鄭成功卻不以力取，而以智奪。他先設下伏兵，然後派他的大將甘輝、萬禮、柯鵬等人前往誘敵，當王邦俊的部隊走到半路的時候，伏兵全出，王邦俊這才知道中了鄭成功的計謀，隻好狼狽逃走。在這次戰役中，鄭成功獲得了許多馬匹和武器。
到了九月，鄭成功再度和王邦俊的軍隊交戰。這一次，鄭成功又設下了許多伏兵，他先命王秀奇和林順先去和王邦俊的軍隊交鋒，然後再叫所有的伏兵傾師而出，把王邦俊的軍隊殺得落荒而逃。王邦俊被鄭家軍打得非常之慘，他手下的兵士全軍履沒。不得已，他隻好厚著臉皮，向上級求援。
十一月，清軍分三路來戰，鄭成功也把自己的軍隊分為三路迎戰。這次清軍雖然有備而來，本想截擊鄭成功後麵的軍隊，結果這項計謀被鄭成功的大將甘輝識破，未能得逞，仍然被鄭成功的軍隊打得落花流水。
永曆六年（1652年）正月初二，鄭成功再度進攻海澄。這次非常順利，他們的船隻趁著潮水，一直到達了海澄的城下。當時海澄的清廷守將赫文興，早就有投降之意，等到鄭成功大軍一到，他馬上就開城請降。