魏忠賢首先打擊的東林黨人是在移宮案中使絆的楊漣。
那時候，魏忠賢地位還不夠穩固，因此對楊漣同樣隻有下暗招。
作為明末曆史上深明大義，不畏強權的忠臣楊漣，同時也是知識分子的標杆。和閹黨勢力進行了堅決的鬥爭。楊漣，湖北廣水人，萬曆三十五年（1607年），楊漣登進士第。曾經在常熟擔任過知縣，任職期間，不辭辛勞，為全麵摸清當地民情，他常常青衫布履，深入田間、民舍，微服察訪，遍知閭裏利病，深受百姓擁戴。在官員的考核中“舉廉吏第一”，因為為政清廉，素有美名，得以升為戶科給事中（負責監察財政係統的官員），不久又改為兵科右給事中。幹的工作還是做監察，估計是吏部看他為人光明磊落，正直忠誠。
萬曆四十八年（公元1620年），萬曆皇帝朱翊鈞病重，鄭貴妃與外朝的官吏多有勾結，離間神宗與太子朱常洛（明光宗）的骨肉之情，她想借此機會升為皇後，群臣中楊漣識破了鄭貴妃的奸計，挺身而出，讓朱常洛一直守候在父親身旁，保證了帝王權力移交的順利，使得鄭貴妃奸計沒有得逞，明光宗繼位不久，鄭貴妃又心生一計，讓明光宗升她為太後，楊漣上疏堅決反對。
一個月後，明光宗病重駕崩，在臨終之前，因為楊漣做事可靠，所以特地破例讓楊漣當上了顧命大臣。評論他是：此真忠君。
光宗死後，他的寵妃李選侍想要效仿當年的鄭貴妃，要求封後。準備將朱常洛的長子朱由校藏起來，“挾皇長子自重”。占據乾清宮不肯搬離，還是楊漣挺身而出，推開在門口戒嚴手持木棍的太監們，帶領群臣，進宮哭臨。然後又和王安等諸位大臣一道，從李選侍手中搶出皇太子，帶到文華殿。口呼萬歲，擁護皇太子登基。朱有效即帝位之後，他又對李選侍堅決抵製，多次要求她搬離乾清宮，在他的堅持努力下，李選侍才從宮中搬出，情不情願的搬入仁壽殿。