從這個角度說，天啟皇帝在這個時候的確不傻。他對寧遠戰略地位的認識，比明朝的很多官員都要有遠見，對袁崇煥的支持力度也很大。這是取得寧遠大捷的重要因素。但要說魏忠賢在這裏麵有什麽大的功勞，則沒有看出來。
但天啟皇帝在為這個勝利論功行賞的時候，卻重賞了魏忠賢和他的家人，他的一個侄兒被連升九級，加封太師，排在三公的首位。這是明代一來除了張居正很少有人得到這樣的官職和榮譽。魏忠賢的兩個侄孫才三四歲也被封為侯爵和鉑爵。袁大人等浴血奮戰的將領則是按照普通戰功升一級了事。
天啟皇帝朱由校對袁崇煥的做法和部署不滿，給予批評。
袁崇煥剛正勇武，富有謀略，在天啟年間的政治版圖中依恃東林黨，他考中進士的主考官韓（火廣），推舉他的禦史侯恂等人都為東林黨的黨魁，為人孤迂忠耿，性格光明磊落，當時魏忠賢如日中天，在明朝取得寧遠大捷後，派遣太監劉應坤、紀用等人前往遼東，意圖監督袁崇煥，控製兵權。袁崇煥當然不肯挪用軍餉去孝敬魏忠賢，為了明朝邊關大局，他在各省在為魏忠賢大建生祠的時候，也委曲求全，違心的在薊遼為魏忠賢建生祠。但君子小人勢同水火，他還是不被魏忠賢所喜歡。
袁崇煥早在任職遼東巡撫的時候，就與投靠閹黨的遼東經略王之臣不合。當時魏忠賢專權跋扈，讓袁崇煥管理關外，王之臣管理關內，隨後不久又提拔王之臣擔任兵部尚書。
兩人矛盾叢生，魏忠賢更是看袁崇煥不順眼，就指使言官上疏彈劾袁崇煥的過錯，說他沒有對錦州進行救援是“暮氣”。袁崇煥心灰意冷，不再解釋，自稱身體抱恙，請求辭職，七月初二，魏忠賢得到報告後，立馬批準，準許其回籍養病。初三便讓兵部尚書王之臣擔任薊遼督師兼遼東巡撫，全麵執掌遼東軍政大權。