從西苑回來的第二天，崇禎下旨，將熊文燦削職，聽候勘問，將總兵左良玉貶了三級，將另一個總兵張任學削籍為民。這天下午，他在文華殿召見楊嗣昌密商大計。
近幾天來，楊嗣昌看出來皇帝有意派他去湖廣督師，又想留他在朝廷“翊讚中樞”。他自己也把這問題考慮再三，拿不定最後主意。他很明白自己近幾年身任本兵，對內對外軍事上一無成就。幾個月前因清兵入塞，破名城，擄藩王，損主帥，皇上為輿論所迫，不得已將他貶了三級，使他戴罪視事。不料如今熊文燦又失敗了，而文燦是他推薦的。若不是皇上對他聖眷未衰，他也會連累獲罪。春天，他建議增加練餉每年七百三十萬兩，隨田賦征收，以為專練民兵之用，遭到朝廷上多人反對。如今練餉馬上就要開征，必然會引起舉國騷亂。可是編練數十萬民兵的事，決難實施。倘若練餉加了之後而練兵的事成了泡影，他就不好下台。近一年來，朝野上下罵他的人很多，他很清楚。雖然他全是遵照皇上的旨意辦事，但是一旦皇上對他的寵信減退，朝臣們對他群起抨擊，皇上是決不會替他擔過的。如其到那時下詔獄，死西市，身敗名裂，倒不如趁目前皇上寵信未衰時自請督師。他相信自己的做事練達和軍事才能都比熊文燦高明得多，加上皇上的寵信，更加上以輔臣之尊，未出師就先聲奪人，成功是有指望的。但是他也想到目前將驕兵惰，兵餉兩缺，加上天災人禍弄得人心思變，大江以北幾乎沒一片不亂土地。萬一出師無功，將何以善其後呢？
形勢急迫，不管對崇禎說，對楊嗣昌說，這個問題都必須趕快決斷。在文華殿召對時候，雙方都在揣摩對方心思。崇禎先問了問軍餉問題，隨即轉到湖廣和陝西軍事方麵，歎口氣說：
“朕經營天下十餘年，用大臣大臣瀆職，用小臣小臣貪汙，國家事遂至於此，可為浩歎！如今決定拿問熊文燦，置之重典，以為因循誤事、敗壞封疆者戒。洪承疇尚能做事，但他督師薊遼，責任艱巨，無法調回。舉朝大臣中竟無可以代朕統兵剿賊之人！”