經過兩次廓爾喀戰爭，乾隆認為，之前的《西藏善後章程》隻有十三條，不足以應對西藏的變化，因此之後又詳加集議，這一日，新的《藏內善後章程》擬定完畢，共二十九條。乾隆讓和珅、福康安、孫士毅一一看過了，道：“先前西藏、蒙古活佛轉世之法，流弊甚多，今日朕定此金瓶掣簽之法，自當大公至正，但凡轉世，皆係天數，非人力可以幹預其中了，你等可還有異議？”
（注：所謂“金瓶掣簽”，是清代起應對藏傳佛教轉世靈童的選舉方式，即預先準備皇帝特賜金瓶，將可能成為“轉世靈童”的孩童姓名寫於簽中，放入金瓶之內，所抽出的即為新任活佛，即使所尋靈童隻有一人，也應準備另一空簽，如抽到空簽，則應另尋靈童。至本書完成之時，此規定依然有效。）
三人看了，覺得此舉並無不妥之處，更何況乾隆詢問，向來隻想著臣下奉旨去辦，又哪裏有異議可言？一時各自稱是，眼看這番集議即將結束，卻聽福康安道：“皇上，臣鬥膽保舉一人為雲南按察使，還望皇上允準。”他素來深受乾隆寵信，故而也有底氣說出這番話來。
乾隆神色不變，道：“但說無妨。”
福康安道：“回皇上，臣聽聞詹事阮元，文章典雅，精於學術，又兼其祖為朝廷參將，想來軍務也自通曉。雲南地處邊陲，非文武兩兼之人，不能為長吏。臣想著阮詹事已是三品，轉為按察使並無不當，也可使其文武之才得以施展，臣赤誠為公之心，還望皇上明鑒。”福康安之前乾隆萬壽之時，即想著若是阮元真有才幹，定要招致麾下。但彼時邊事繁忙，萬壽慶典之後不久他便離去，也未能向乾隆稟報。此時他已調任雲貴總督，故而舊事重提，想著先把阮元安插到自己身邊，之後再看他行事。他所提拔舉薦多是武臣，與文官來往不多，是以也想著在文臣中扶植一二親信，以鞏固自己地位。