普京憑借著敏銳的政治觸覺在千鈞一發之際站對了隊伍。盡管政變的混亂局麵得到了暫時的控製，但是在黨和國家的領導層之間，依然存在著暗流湧動，鉤心鬥角，畢竟每個人所代表的政治立場是不盡相同的。當時，蘇聯最高蘇維埃的成員差不多都是共產黨員，他們對於葉利欽的政策是極為不滿的。軍人出身的副總統亞曆山大·魯茨科伊也對葉利欽有所不滿，並且和車臣最高蘇維埃主席魯斯蘭·哈斯布拉托夫結成了統一聯盟，共同構成對葉利欽的強大威脅。
就這樣，雙方在關於建立怎樣的一個政體上展開了尖銳討論。葉利欽的意見是建立一個總統共和體製的聯邦國家，而哈斯布拉托夫則主張建立議會製共和國。
1993年9月21日，葉利欽宣布了解散最高蘇維埃和人大會的決定，並公布將在年底進行新的立法機構選舉，選舉後將成立國家聯邦議會。而此時的人大會卻與葉利欽唱起了反調，不僅統一了口徑，彈劾總統，還占領了白宮。事態一下子陷入了僵局，沒有了任何和平解決的希望。葉利欽最終決定用武力強迫這些人向議會俯首稱臣。
10月3日，葉利欽宣布莫斯科進入緊急狀態，並且調遣了軍隊進入莫斯科。10月4日淩晨，俄羅斯的聯邦軍隊向當時的議會所在地——白宮進行了炮轟，特種兵很快就以強大的攻勢占領了白宮議會大樓，造成了大批白宮守衛人員的傷亡，哈斯布拉托夫、魯茨科伊最終成為了戰俘。這就是俄羅斯當代史中非常著名的“炮打白宮”事件。
在這次事件當中，普京再一次選擇與自己的導師索布恰克站在一起，共同擁護葉利欽的決定，聖彼得堡的局勢很快得到了控製。
在經過兩次的生死考驗之後，普京所表現出來的忠誠讓索布恰克著實感動，普京在危難時刻所表現出的那種鎮定自若、處變不驚也深得索布恰克欣賞。在他的心裏，普京就是他自己的人，甚至是完全可以信賴的。