慈禧終於如願以償，她聯合恭親王，僅用兩天的時間，便順利地處置了八個顧命大臣，不費一兵一卒搞成了一場政變，為自己垂簾聽政掃清了道路。
十月初五那天，慈禧通過奕訴下令取消八個顧命大臣為新皇帝擬定的“祺祥”年號，而代之以“同治”年號，以第二年為同治元年(1862)。十月初九，新皇帝同治在太和殿舉行登基大典。同時，給皇太後上尊號。鈕祜祿氏被尊稱為慈安皇太後，那拉氏被尊稱為慈禧皇太後。新皇帝還發布聖旨，規定各省和各路軍營的奏折都必須首先送呈兩宮皇太後過目，然後交給議政王和軍機大臣詳議，提出處理辦法，之後報請兩宮皇太後批準，由軍機處按照皇太後的意見草擬聖旨，最後經皇太後審定頒發。這樣一來，兩宮皇太後對朝政便有了裁決權，而議政王奕訴則具有了行政權。這也就等於宣布了皇太後主政。
過後，王公大臣和六部九卿又用了十餘天的時間，製定出了皇太後垂簾聽政的章程。這個章程共有十一條，詳細地規定了太後垂簾聽政的具體章法。主要內容是皇太後批閱奏章、召見大臣、裁決政務、任免官員。按照這個章程，於十月初一日，舉行了太後垂簾聽政的儀式。在養心殿內，六歲的新皇帝載淳坐在禦座上，在皇帝身後放著一道黃色的紗屏風，屏風後麵一左一右坐著慈安太後和慈禧太後。議政王奕訴率領眾大臣在養心殿前叩拜。然後，奕訴進入殿內，站在皇帝禦案的左側。大臣們所上的奏折，由奕訴轉呈皇帝，並向兩宮皇太後提供處理意見，紗屏後麵的兩位太後的意見，通過奕訴傳達給百官。清朝曆史上前所未有的太後垂簾聽政時代就這樣開始了。
慈禧實現了自己的願望，可是，她卻假惺惺地發出一道上諭，說什麽垂簾聽政本來不是自己內心樂意幹的，隻是因為國家麵臨許多困難，皇帝年幼，而大臣們又不能沒有遵循，因此才不得已答應了大臣們的請求，暫時主持朝政，等皇帝長大之後，就把政權交給皇帝。