慈禧依靠奕訴徹底粉碎了讚襄政務大臣。她深知她之所以能夠垂簾聽政，如沒有奕訴的大力支持是不可能的，而且自己沒有從政經驗，凡事都離不開奕訴，所以，在垂簾聽政之初，一切國家大事放手交給奕訴去辦，想方設法籠絡奕訴。比如，封奕訴為議政王的同時還封他“世襲罔替親王”,即俗稱的“鐵帽子王”,王爵世代相傳。奕訴對此封贈極力推辭。最後，慈禧改為賞他親王雙俸，加倍地給他俸米、俸銀。又如，同治三年(1864)正月初二，慈禧封奕訴的大女兒為固倫公主。按慣例，隻有皇後的親生女兒才能獲得固倫公主的封號，奕訴不是皇帝，他的福晉自然不是皇後，而他們的大女兒卻得到這個封號，這在清朝曆史上是空前絕後的。在同一天，慈禧又賞給奕訴在紫禁城內乘坐四人轎的特權，賞給奕訴的大兒子載激三眼花翎頂戴。再如，慈禧還將奕訴的母親向鹹豐皇帝爭要而沒要成的“康慈太後”的封號，送給了奕訴已故的母親，並下令將其靈牌請進太廟，享受正式皇後的待遇等……
奕訴對西太後感激涕零，西太後對奕訴依為心腹。可是，舊的矛盾解決了，又出現了新的矛盾，所以這種和衷共濟的關係並不長久。慈禧經過一段垂簾聽政，對處理國事，駕馭官僚積累了經驗，而奕訴果決善斷，不拘小節，甚至僭越太後，招致了慈禧的嫉恨，乃至同奕訴發生衝突。
比如，奕訴為了盡快鎮壓太平軍，他大力啟用漢人官僚，如曾國藩、李鴻章等。此舉為一些心胸狹隘的滿族官吏所不滿，甚至把風吹到慈禧耳邊。慈禧對此也有想法。一次她責怪奕訴盡用漢人，挖苦地說： “這天下咱們不要了，送給漢人吧!”奕訴非但不服，反而同她爭辯，把慈禧駁得無言以對，最後，慈禧賭氣地說： “你事事同我為難，我罷你的官!”奕訴針鋒相對地頂撞， “我是道光皇帝的六兒子，你能把我的官罷了，可是，你撤不掉我這皇子的身份!”說罷，索性不跪了，站了起來。慈禧覺得太丟麵子，一時又說不過奕訴，最後竟使出了潑婦的手段，扯著嗓子喊： “你們看，六王爺要打我啦!”事情鬧得不可開交，最終還是太監把奕訴連勸帶推地送出宮門，才算完結。