包圍燕王府的士兵不知道張員、謝貴二人會被殺，在燕王府外邊等了一個多時辰，不見二人出來，便陸陸續續地離開。繼而，燕王便讓人傳諭包圍北平的將士，並對外宣布張員、謝貴二人已經被擒獲，讓他們各自撤回。這些將士本來大都是燕王的部下，看到這種情況也都紛紛離去。
燕王命張玉、朱能乘夜色掩護去攻奪九門。張玉和朱能帶兵突然出現的時候，守城門的士兵懾於燕王的聲威，倉促之間手忙腳亂，無心應戰，有些城門不戰而下。至天明時，北平的九個城門已奪占了八個，隻有西直門暫未攻下。
這時，北平都指揮彭二得知燕王舉兵反，便急忙騎馬在街上大喊：“燕王反，從我殺賊者賞。”很快集中起來千餘人，向端禮門發動攻擊。燕王手下的將士從府中衝出，經過一番激烈廝殺，將彭二殺掉。彭二部下的士兵也隨之潰散。
西直門的守兵比較忠勇，頑強固守。燕王命指揮唐雲單騎前往，傳諭守兵道：“你們不要自討苦吃!現在朝廷已聽任燕王自製一方，你們趕快離開，否則格殺勿論。”守門將士聽了這話，看到其他八處都已被燕王的士兵占領，料難抵擋，便很快都散去。至此，北平的九處城門都被燕王攻占。燕王下令安撫軍民，北平很快安定下來。
燕王對葛誠、盧振背叛自己非常氣憤，不僅將二人殺掉，還殺了他們的全家。這時也有公開勸阻燕王起兵的，他們不知道當此爭奪皇位的時候，任何忠義的說教都打不動他的鐵石心腸。
燕王控製了北平以後，原北平的官員紛紛歸降燕王。
燕王出兵以前，把金忠召來，讓他占卜一下吉利與否。金忠占了一卦後，謂誓師起兵“大吉”。燕王聽了很高興，隨即任命他為紀善，隨侍左右，讓他隨時幫著出謀劃策。燕王有了什麽疑難事，也經常征求他的意見，他成了燕王的一個重要謀士。燕王起兵後，三天便“城中大定”,接著就召集將士，舉行誓師。正式打出了“奉天靖難”的旗號。