官軍向南敗走，燕軍隨後追擊，前後相距不過十餘裏。朱棣派遣都督陳文、李遠前往淮河哨探，又擊敗了淮河守軍，奪得幾百匹馬還差點奪了他們的浮橋。
四月十四日，官軍依然南逃，燕軍緊隨其後，相繼來到小河。小河又名睢水，西從河南永成縣流入，東至睢口，注入黃河。朱棣說： “賊勢窘迫，必求一戰，我據險以待之，使進則鎰其吭，退則拊其背，不日之內可擒矣。”他命令都督陳文、內官狗兒去河北要衝之處斷水為橋，令步兵輜重先行過河，騎兵隨之，然後派兵把守此橋，以困敵軍。
第二天，何福率官軍沿河布陣，達十餘裏，成左右包抄狀，緣河向東推進。朱棣常領騎兵應戰，官軍騎兵哪裏是燕軍的對手，膽怯至極，一戰即潰。何福命步軍蜂擁而上，爭奪渡橋，又為陳文戰敗。何福率軍上前應援，兩軍展開遊戰，斬陳文於陣中，官軍乘勢衝殺過橋，平安轉戰至北阪，挺槍向燕王刺來，眼看就要刺中，而平安的坐騎忽然馬失前蹄，燕軍番將王騏見燕王危急，衝入陣中，拽起燕王便走。朱棣二子朱高煦率都督張武，內官狗兒率一批勇士猛然間從林衝殺出來，與朱棣率領的騎兵合為一股，聲勢再起，官軍不能阻擋，大敗。
燕軍越殺越勇。前後斬殺官軍二萬餘人，不少人渡河逃命溺死水中，屍體堵塞，河中一時為之斷流。官軍將領丁良、朱彬也成了俘虜。此時，官軍退回南岸，燕軍也不能過河，兩軍隔河形成對峙之狀。
幾天下來，戰事並無明顯變化，隻是天氣越來越熱。這時官軍的糧食已使用盡了，士兵隻能采野菜充饑。朱棣得知官軍的情況，說道： “賊眾饑甚，今與之相持，彼居南岸，便其饋餉。更一二日，運糧稍集，賊眾得濟，難以破之。”
朱棣想乘官軍糧餉不濟之機，一舉打敗官軍。於是他下令留下守橋士卒千餘人不動，暗中親自帶大軍輜重向東轉移，在離官軍三裏的地方，乘半夜渡河到南岸，繞到官軍之後。燕軍調動完畢，官軍竟然沒有發覺，到