就在秦始皇兵馬俑脫離了土地神的庇護而投入到現代人類的懷抱之時，今天的人們對這支秦代大軍所提出的苛刻的保護要求感到棘手，甚至不知所措，由此而引出的失誤與缺憾、憂思與困惑，也就無法避免。
關於文物保護的困難與無奈，秦俑博物館文物保護專家薑彩凡曾做過這樣的解釋：文物保護不僅要防止人為因素對文物的破壞和損害，而且要防止自然因素對文物的破壞和損害。後者與前者相比更難。因為一切文物都由各種質地的材料構成，它雖處於宏觀靜止狀態，但始終進行著微觀運動。在環境因素的影響下，微觀運動不僅能使文物外觀形態變形，且常引起文物質量的變化，導致文物損壞，失去原有的價值。如氣候變化、陽光輻射、空氣汙染、害蟲蛀蝕、黴菌繁殖等自然破壞力，會使文物不同程度地損壞。如溫濕度的變化會引起金屬腐蝕礦化、土遺址因風化會出現幹裂、陶質文物出現酥堿粉化等。就兵馬俑坑的情況而言，根據文物保護專家張誌軍對一號坑大廳十餘年的監測結果得知：下雨或下雪的異常天氣，都會使坑內濕度相對上升10%以上，而在正常天氣中，陽光的照射可導致坑內溫度在短短的2個小時之內上升7℃以上，濕度卻又相對地下降13%以上。這種溫濕度的巨大反差和迅速變化，對坑中的秦俑表麵彩繪特別是在修複中粘接陶片的環氧樹脂化學膠，都會造成極大的損傷並縮短本身的有效壽命和應起的關鍵作用。而大廳的建築結構使深入地下4.5米但體積較小的三號俑坑溫濕度的反差更為明顯，損害力也將更為嚴重和突出。
考古人員正在為新出土的彩繪俑做護理工作
再如秦俑坑土質的黃沙積成，經保護專家周鐵於20世紀90年代初期測試，黃沙土質失水後體積收縮約30%左右。由於日光的曝曬，俑坑中的土隔梁漸已收縮裂變，而驪山腳下農民采石炸山所發起的隆隆炮火，給近在咫尺的秦俑坑帶來了相當於人們已有輕微感覺的三級地震。從而使俑坑土隔梁的裂縫越發增大並延伸，有頃刻塌陷覆沒陶俑的危險。據考察，在一號坑中部有一條橫貫整個俑坑的巨大裂縫，這條裂縫已穿透大廳牆基並延伸到大廳外部，對這座高大恢弘的拱形建築構成了極大的威脅。