1922年1月1日，《學衡》雜誌在南京創刊，吳宓出任總編。雜誌宗旨很明確，就是要“論究學術，闡求真理，昌明國粹，融化新知，以中正之眼光，行批評之職事，無偏無黨，不激不隨。”雜誌是文史哲綜合性刊物，欄目有：通論、述學、文苑、雜綴、書評、附錄、插圖等。
《學衡》沒有政治和經濟上的依靠，東南大學並沒有給它提供經費，雖然辦刊艱難，但保證了它的獨立性。因為經費的原因，當時《學衡》的作者是沒有稿費的，就連辦刊基本的印刷費用都是最初的骨幹成員每人出的一百元基金費。
為了節省《學衡》的辦刊經費，吳宓把自己在鼓樓的住處作為編輯部。《學衡》沒辦幾期，雜誌的大小事務基本上都是吳宓一手承擔，而且後來連出刊的所有費用，也是靠他自己的工資墊付，或者找親友募捐的。
缺少經費、以及缺乏朋友的理解，開始逐漸成為吳宓的困擾。梅光迪自第二年1月第13期開始，就不再為刊物撰稿，並對人說：“《學衡》內容愈來愈壞。我與此雜誌早無關係矣！”
1926年11月、12月間，負責《學衡》雜誌印刷的中華書局多次給吳宓去信，表示《學衡》五年來的銷售量平均隻有數百份，公司虧大了，不能再繼續印刷了。
吳宓開始四處托人說情。他先找到《大公報》主編張季鸞，請他問一下上海的泰東書局能不能把印刷《學衡》的事務接過去，得到的回複是無能為力。他又托人向梁啟超求助。中華書局看在梁啟超的麵子，答應續辦，不過附加有條件，主要是增加印刷費、減少每期雜誌的頁碼、取消每期贈送的150冊雜誌、雜誌內取消插畫、紙版歸中華書局。反正就一句話，要接著辦也行，吳宓這邊得多加錢，中華書局這邊得減少投入。後來終於商量妥當了，雜誌改為雙月刊，每月多加印刷費100月。