在武漢解放前，吳宓飛到了重慶，原本他是想從重慶再去成都出家當和尚去的。但到了重慶之後，因交通困難，去不了成都，隻能繼續呆在重慶。吳宓想他要先研修佛教，等時機成熟就出家為僧。
正是出於這樣的想法，他才去了相輝文學院和勉仁文學院任教，那裏以講儒學為主，講佛學為輔。
初到相輝文學院、勉仁文學院這些私立高校時，吳宓是有些看不上眼的。相輝文學院有些學生夜夜在校外的茶館賭博，輸贏多達1000銀元，卻不肯交納35銀元一學期的學費。更可氣的是，這些學生還說什麽該把教授的薪金減低，這樣他們的學費就可以減少了。吳宓想，在相輝文學院呆久了，以後還不定會出什麽幺蛾子，所提心中開始打著主意隨時準備離開。
但呆久了之後，吳宓才發現相輝文學院的師生中居然還藏龍臥虎。老師中熊十力、羅庸、孫伏園等都是有真才實學的學者，學生中後來也有很知名的，比如“中國雜交水稻之父”袁隆平。但遺憾的是，相輝文學院在上個世紀五十年代就結束了。
1949年11月，重慶解放。老百姓頭上的三座大山被搬除，街上敲鑼打鼓，鞭炮長鳴。
1950年4月，重慶相輝文學院、勉仁文學院相繼被撤銷、合並之後，吳宓被調到在重慶磁器口新成立的西南師範學院任教。初期的西南師範學院，是由四川教育學院和國立女子師範學院合並而成。1951—1952年間又將重慶大學、四川大學等七所院校有關學科合並進來，校址遷往北碚。
經過一番歲月的洗禮，吳宓過去的學生發現老先生與先前不同了，人老了，瘦了，服裝也變了。以前在西南聯大，他還穿西裝，臉上的絡腮胡子刮得光光的，現在穿的是寬大的長衫，禿頂的範圍擴大了，胡須也刮得沒有以前那麽光了，仍然拿著手杖，過去是提而不拄，現在是拄地而行了。