當“教授治校”決定國立清華大學發展的柱石，被梅貽琦賦予校內合法地位並夯實鐓牢後，清華這個在曆史夾縫中鬧騰了20年的“政治皮球”，於“九一八”學潮稍微緩和之後，終於在正常的軌道上運行起來。
梅貽琦是一個富有理想，且把理想與現實結合、設法落到實處的實幹家。按既定計劃，他要做的幾件大事包括增聘教授，擴建圖書館、體育館、教職員與學生宿舍，充實圖書儀器，加強文、理、法三個學院陣營等等。
1932年2月，梅貽琦又提出清華“擬向工程科學方向發展”，以配合政府發展國家急需的理工學科，滿足工業界實際需求。而適應這個需求最切實的，就是設立專門的工科院係。可意想不到的是，就在梅貽琦準備施展抱負的時候，一件令他備感頭痛的事發生了。
清華庚款基金自1929年由中基會“永久保管”後，因為管理得當，盈餘基金逐年增加，各方都感到非常滿意。1929年至1931年，由中基會代領的美國每月退回賠款，除撥匯留美經費外，餘款悉數按規定撥作清華大學經費。
按原定計劃，自1932年至1940年，每月退款數目增加，每年約有138萬餘元。《章程》規定，清華大學的常用經費每年為120萬元國幣，餘額留作基金，在庚款未滿期間，基金本息不得提用，滿期後隻可動用基金利息。中基會根據教育部核準的清華大學及留美學生經費預算，每年分別發放應用。
梅貽琦在1931年12月3日上午做就職演說時，第一條就談到了清華的經濟，並說清華的經濟在國內算是特別好，清華也是特別的幸運，繼而談道：“如果跟外國大學的情形比起來，當然相差甚遠，譬如哥倫比亞大學本年的預算，共有三千六百萬美金，較之清華，相差了不知多少。但是比起國內的其他大學，清華的經濟不能算少，而且比較穩定。我們對於經濟問題，有兩個方針，就是基金的增加和保存。我們總希望清華的基金能夠日漸增多，並且十分安全，不至動搖清華的前途。然而我們對於目前的必需，也不能因為求基金的增加而忽視，應當用的時候我們也還得要用。不過用的時候要力圖撙節與經濟罷了。”