曹操挾天子至都許，使皇帝完全擺脫了其他軍事力量的控製，而置於自己的掌握之中。對立的軍事力量趕走了，但隨駕的諸多文武大臣則必須準其入許。這些隨駕入許的大臣，尤其是頗有名望的三公宰輔，對於自己握權以總的目標仍不失為一種威脅。
曹操很明白，要解除這種威脅，必須兩手兼用，或罷或殺，或封或賞。對此，曹操自入洛陽迎漢獻帝即已開始。都許以後，曹操急於穩定局勢，鞏固並提高自己的權勢，以利大業和征討不臣之事，因而加緊了剪除異己的步伐。其實，許多人很難算得上是異己，隻不過是稍出微詞或略示慍色而已。
曹操首先向最有影響力的三公發難。
建安元年(196)九月，罷太尉楊彪、司空張喜。楊彪，四世太尉，德業相繼，與袁氏俱為東漢名族，自董卓亂起，盡節衛主，從洛陽到長安，又從長安回到洛陽，繼而從東都許，既有如此之地位，又有如此之功的人，對於曹操無疑是一種權力的威脅。曹操將其趕出朝廷，這是曹操剪除異己的開始。四年後，還給了楊彪一個掌管宗廟禮儀的官——太常卿。
司空張喜是以什麽理由罷的，史無可證。但總會有個不成理由的理由，因為官居公卿是不能隨便罷黜或殺的。
至於那些非公卿之流的一般官吏，雖然也不能隨便濫殺，但就當時來說，根本無需什麽正當的理由和借口，曹操如果覺得討厭即可殺掉。
曹操在誅戮朝中異己的同時，為了許都的安寧和便於行使權力，立即著手對近許之敵和勢力用兵。當時兵馬最強、離許最近的是楊奉。楊奉曾相信董昭以曹操名義寫的信，以為曹操能與自己“死生契闊，相與共之”,因而表舉曹操為鎮東將軍，襲爵費亭侯。及至曹操“移駕”,楊奉始知上了當，曾想發兵截擊，但已經來不及了。楊奉駐梁(今河南商丘境)是直接影響朝廷穩定的一股勢力，因而曹操把楊奉視為心腹之患，確定為第一個用兵目標。是年冬十月，曹操發兵征楊奉，楊奉、韓暹南奔袁術，從而解除了近兵之憂。