弘道元年(683)十二月四日，唐高宗死於洛陽宮之貞觀殿，享年五十六歲。遺詔： “七日而殯，皇太子即位於柩前，園陵製度，務從節儉。軍國大事有不決者，取天後處分。”
有人認為唐高宗是受武則天迫害而死的，論據是高宗病危時， “武氏不欲上疾愈”。其實，這種看法完全是出於對武則天的憎恨而強加給她的不實之辭。如前所述，自當上皇後以後，武則天曾進行了解除威脅、扶植新貴、參預朝政等許多活動。這些活動，絕大部分都是經過唐高宗允許的，甚至是與唐高宗合作進行的，並沒有構成對唐高宗的迫害。
恰恰相反，正是通過這些活動，唐高宗才擺脫了長孫無忌、褚遂良等人的控製，才得以在百病纏身的情況下“執政”三十四年，維護唐王朝的強盛局麵。唐高宗病重時，武則天一直守護在身邊。隻因禦醫請在高宗頭上進行針刺出血時，武則天說了句“此可斬也，乃欲於天子頭刺血!”便被有些人抓為把柄，說她“不欲上疾愈”。其實這正是出於對高宗的愛護和關心。
大量資料表明：唐高宗也是因病而死的。高宗自顯慶五年十月染上“風眩頭重，目不能視”的疾病，在以後的二十多年時間裏，此病時常複發，並且一次比一次嚴重。至弘道元年秋，病情終於達到惡化的地步。史載，弘道元年十一月，高宗幸奉天宮， “疾甚”,頭重目眩，無法忍受，急召侍醫秦鳴鶴、張文仲醫之。秦鳴鶴認為，刺頭出血可愈。武則天覺得危險，反對在頭部針刺。唐高宗說： “但刺之，未必不佳。”於是，秦鳴鶴在高宗的“百會”和“腦戶”二穴上刺了幾針。這幾針當時還真管用，高宗覺得眼睛似乎可以看見了，很高興。
武則天在旁也很激動， “再拜謝，曰： ‘天賜我師!’”親自“負彩百匹以賜鳴鶴”。但她萬萬沒有想到，秦鳴鶴的這幾針，隻起了回光返照的作用。高宗隨即病危了。十一月下旬，唐高宗在武則天的護理下回到洛陽。病情加劇，遂至彌留。就這樣，唐高宗離開了人世。