如何變高麗“蠻貊之鄉”為隋朝的“冠帶之境”,在隋煬帝的外事顧問裴矩看來易如反掌。大業三年，裴矩在突厥啟民可汗帳前向隋煬帝策劃並獻計：“今其使者朝於突厥，親見啟民。合國從化，必懼皇靈之遠暢，慮後伏之先亡，脅令入朝，當可致也。”而隻要讓高麗使突厥使者回國向國王傳話， “令速朝覲，不然者，當率突厥，即日誅之”。在裴矩看來，似乎隻須一聲恫嚇，高句麗就會乖乖降服，高元也隻好乖乖來朝。
隋煬帝當即采納了裴矩的意見，下令征高元入朝。結果，事情並不像裴矩幻想的那麽簡單，高元懼， “藩禮頗闕”,不但不像突厥啟民可汗、高昌王翻文泰那樣“親詣闕貢獻”,反而斷絕了朝貢使者，也就是說幹脆不與隋往來了。
這當然激怒了大隋皇帝楊廣。
隋煬帝定下討伐高句麗的決心大約就在大業三年之後。大業四年(608)正月，他詔發河北諸郡男女百餘萬開永濟渠，顯然就是為征討高句麗作準備。《隋書·閻毗傳》記閻毗“以母憂去職，末期，起令視事。將興遼東之役，自洛口開渠，達於涿郡，以通運漕，毗督其役”。同書《五行誌下》記這年太原廄馬死者大半，隋煬帝令巫者視之， “巫者知帝將有遼東之役，因希旨言曰： ‘先帝令楊素、史萬歲取之，將鬼兵以伐遼東也’。隋煬帝大悅，因釋牧馬者”。
永濟渠北通涿郡，隋煬帝詔令聲討高句麗及發兵的地點，都在涿郡，永濟渠的開鑿，有利於隋征調全國兵力及運送全國物資到涿郡。隋煬帝既在大業五年(609),將吐穀渾納入隋郡縣體係中，將高句麗重新歸入王朝版圖也自然已在他的通盤計劃之中。隋煬帝先巡江都，作軍事調度，然後沿大運河直達涿郡，正式總動員令隨即下達了。《資治通鑒》中記隋煬帝的軍事動員和調動情況：