青海和碩特叛亂首領羅卜藏丹津逃亡準噶爾，為策妄阿拉布坦所接納，清朝政府索要，策妄阿拉布坦拒不交出，由此可以看出雙方處於敵對狀態，這是康熙末年雙方關係的繼續。
自從撫遠大將軍允褪在康熙六十年(1721)五月移駐甘州(張掖),對準噶爾采取進攻的態勢，但是康熙實行的是防禦性手段，沒有深入賊巢徹底消滅叛軍的打算。雍正即位後，即以兵丁在前線日久，勤勞過度，撤回內地。與此同時，策妄阿拉布坦也派遣使臣根敦到京城講和，雍正則厚禮相待，以事籠絡。時值雍正二年(1724)元旦，該使臣要求隨同廷臣一起朝賀，雍正讓他與朝鮮使臣一道行禮，事後，雍正說“其行禮時，光景十分虔敬”,大約是反映了策妄阿拉布坦講和的一些誠意。因此，雍正派佛保等到準噶爾議和，然遇到羅卜藏丹津的幹擾，談判頗不順利，策妄阿拉布坦又遣人至京，雍正如同前次厚禮相待。但是沒有商談出結果，雙方依然處於敵對狀態。雍正因內部事務繁多和經濟力量不足，暫不用兵，而密切注視對方的動靜，尤其留心它同西藏的關係和它對喀爾喀蒙古的侵淩。因此，雍正初年，受形勢所迫，雍正渴望和談，實際上是采取的守勢，與康熙末年以攻為守有所不同。
雍正隨著政治改革的實現，政局穩定，財力充足，就具備了解決準噶爾問題的條件。雍正五年(1727)年初就籌謀討伐準噶爾，及至阿爾布巴叛亂事發，促使他下決心用兵，到五年年底，他說： “(準噶爾、西藏)二處實為國家隱憂，社稷生民憂戚係焉，所以聖祖明見事之始末利益之意，滅取準噶爾，安定西藏者，聖知灼見，不得已必應舉行者也。”他認為阿爾布巴事件，正是討叛伐罪的機會，決心雍正六年(1728)解決西藏問題，雍正七年(1729)轉向準噶爾， “命兩路整大兵勒取，相機聲罪致討，必滅此而後朝食”。同年，策妄阿拉布坦死，子噶爾丹策零繼立，雍正認為是可乘之機，從而促使他下定用兵的決心。