傳統叢林道場重視製度，不但個人有戒牒[1]，僧團也有清規[2]。
“清規”是指禪宗寺院組織章程及寺眾日常生活的規則，亦即禪宗叢林關於大眾行、立、坐、臥等威儀所訂定的僧製，為眾僧所必須遵守的儀規，類似現代的“共住規約”，是為僧眾日常修行的規範，以及僧團組織、行事的依循。因此，“清規”是健全僧團的圭臬。
中國禪宗自達摩東來後三百年中，禪僧多依住在律院或岩穴、樹下，並未營立禪刹。直到唐朝“馬祖[3]創叢林，百丈[4]立清規”，才開始營建禪刹，並參照大小乘經律，製定叢林規矩，撰清規二卷，廣為流行，世稱古規、古清規、百丈清規，這是禪宗清規的開始。此後，天下叢林皆依此而為寺院生活的儀則。
由於百丈禪師為禪宗叢林立下《百丈清規》[5]，使得中國的僧團走向製度化、合理化的僧伽生活。例如明定四十八單職事，各司其職，使得寺務運作組織化、係統化；又訂定各種修持行儀、日用軌範等，使得僧眾具足威儀，心不放逸，身不踰矩。尤其設立住持一職，領眾熏修，綜理寺務，叢林規模於焉建立。
可惜《百丈清規》一書曆經時代更迭，今已散佚。現行通用的《敕修百丈清規》，是元代江西百丈山住持德輝奉敕重新編修，其中前四章規定有關祝聖、國忌、祈禱、佛誕節、涅槃節、達摩忌、百丈忌及各寺曆代諸祖忌等儀式，此皆律所未定，古規所缺者；五至九章，則為叢林的規章製度，包括住持日用[6]、職事行事、兩序進退、大眾修持等。
《百丈清規》之後，我國陸續撰出的清規尚有：宋代宗賾作《禪苑清規》[7]、瑞嚴無量宗壽禪師作《日用小清規》、婺州金華惟勉禪師作《叢林校定清規總要》、元代東林澤山弋鹹禪師作《禪林備用清規》、中峰明本禪師作《幻住庵清規》[8]、道齊作《禪苑清規總要》、繼洪作《村寺清規》、明代天界道盛禪師作《壽昌清規》、清道光源洪禪師著《百丈清規證義》等，近代則有《金山江天禪寺規約》、《高旻寺規約》、《佛光山禪堂規約》等。