（一）消極影響
社會各界對於城中村存在的問題已達成共識，並把它看作是城市肌體上的“腫瘤”。這些突出問題概括起來主要有社會治安問題、環境衛生問題、安全隱患問題、計生和人口管理問題、市政配套和城市形象問題等，在此不再展開論述。除此之外，還有城中村催生租金食利階層的隱患等。
1．對城市建設的影響
由於多年來對城中村的綜合管理不當，在利益的驅使下，當地居民隨意增建、搭蓋出租房屋的現象很普遍。同時，由於環境衛生、生活服務等公共配套設施未完善，城中村的髒、亂、差現象嚴重。此外，城中村的存在嚴重妨礙了城市交通網絡的優化，一些城市主幹道由於城中村的阻擋而不能在近期實施，不得不繞道改線，使交通幹道服務區域不能優化配置，對城市的規劃建設產生不利影響，也不利於城市環境保護工作的開展。
2．對城市管理體製的影響
城中村長期保留農村建製，實行農村管理體製，形成了相對封閉的小社會，城中村所在的街道難以按照城市管理體製實施管理。這種城鄉二元管理體製，表麵上兩種管理體製都在實施管理，實際上是哪種體製也沒發揮好作用，造成城中村的規劃、建設、管理長期處於混亂狀態，不利於政府有關部門開展工作，體製上不能製定合理的政策進行規範和約束，造成了房屋建設布局混亂現象，不僅嚴重破壞了城市景觀，影響市容市貌，而且還成為城市最大的衛生死角。城中村雜亂的建築和生活環境，在很大程度上破壞了城市形象，降低了城市品位，削弱了城市競爭力，成為城市現代化的一大障礙。
3．對城市用地的影響
城中村的住宅建設缺乏統一規劃和管理，以單家獨戶建設為主，房屋建築相對於城市來說占地麵積大，建築密度高，容積率低，造成土地利用率和產出率低下。