在勢如破竹的戰爭後，公元前221年，“六王畢，四海一”，曆史進入秦帝國時代。
新生的秦帝國揮別了舊有的國家體製，開啟了一個以皇帝為中心的中央集權製的全新時代。這種製度影響了古代中國兩千多年，直到辛亥革命才被廢除，中國才進入民主共和時代。
秦帝國國家體製的變革先從改變國家最高統治者的名號開始。麵對秦並天下這一史無前例的成功，秦始皇認為不變更名號，無法體現出他功蓋三皇、德高五帝的巨大功業。於是，他在名號上將上古至尊的三皇、五帝各取一字，稱為“皇帝”，從此“皇帝”成了一個新的至高無上的稱謂。與之相適應，命為“製”、令為“詔”。此外，廢除諡法，不允許後人再對死去的皇帝妄加評論。他自稱為始皇帝，後世則以數計，二世、三世乃至於萬世，傳之無窮。
這個新的政權該如何運作？秦始皇有不同的想法，他摒棄了周代的分封製度，以中央集權的郡縣製方式來治理國家。周分封建邦而治天下讓一些秦的重臣記憶猶新，他們主張回到周的老路數上。但是，始皇帝和廷尉李斯從春秋戰國以來的殘酷事實認識到，天下共苦、戰鬥不休的原因就在於分封，要想天下安寧，就不能再分封立國了。
取而代之的是，秦在中央設立三公九卿等官吏，在全國範圍內設立三十六郡（後來增擴調整達到四十八郡），每一個郡都設置守、尉、監，郡守是最高行政長官，尉負責軍事，監是監察該郡的官員，他們都直接聽命於皇帝，享受國家的俸祿，但是不能世襲。在郡下設縣、亭、裏等基層組織，這樣就形成了一套高效完整的官僚體係，皇帝的意誌通過這套體係傳達於全國。
在國家的政治體製確定後，秦更不遺餘力地全麵推行與統一相配套的各項措施。首先是宣布結束戰爭，大酺天下，偃兵息鼓。始皇帝下令收繳天下所有的武器，集中到鹹陽，銷毀熔鑄成十二個鍾鐻金人，放置於鹹陽宮廷之中，這就是向全國宣告戰亂時代的結束，人民可以安居樂業了。接著，在全國範圍內推行各項統一的製度，“一法度衡石丈尺，車同軌，書同文字”。早在商鞅變法時，秦國內部就推行過相似的政策。隨著疆域的擴大，原來僅施於秦國的集權政策就有必要推行到全國；否則的話，還是沒有真正完成統一。