對於一位掌握穩局者來說，各個職能部門都是自己的左右手。職能部門當然有主次之分，而要害的部門一定要牢牢控製在自己手中，而且每一要害部門都要有一批有能耐的“自己人”。對這個問題，康熙始終高度重視，因為他深悉個中玄機。
清朝初年內廷設立書房。天聰十年皇太極改國號為清後又改稱內三院，即內國史院、內秘書院和內弘文院，但性質不變，成為抵製諸王、加強皇權的有力武器。順治十七年，順治帝為加強自己權力，又於景運門內建造直房，選翰林院官員分三班值宿，以備不時召見顧問，成為內廷書房之雛型。
康熙初年，內三院已逐漸成為輔政大臣結黨營私，甚至侵犯皇權的工具，因此康熙在剪除鼇拜勢力之後，立即廢除內三院，重建明代內閣和翰林院建置，並選擇翰林院官員入值內廷，創設南書房。
康熙十三年，沈荃外擢國子監祭酒，次年熊賜履升為內閣學士並超授武英殿大學士兼刑部尚書，不久又因事奪官僑居江寧，南書房乏人。而此時正是平定“三藩”叛亂決戰勝負的關鍵時刻，急需補充水平更高的儒臣入值，以備隨時谘詢、應對。
內閣漢大學士李蔚、杜立德等人，遂即會同翰林院掌院學士，選送張英等翰林五人具奏。經康熙親自篩選，確定侍講學士張英入值南書房，食四品俸；書寫之事隻令高士奇負責，食六品俸。他們和勵杜訥一起，均於皇城之內賜第。
自此以後，入值南書房的內廷翰林，不僅輔導皇帝讀書寫字，講求學問，時備顧問，而且還代擬諭旨，編輯典籍，從而使南書房在交流民族文化、緩和民族矛盾方麵發揮了重要作用。
特開博學鴻儒科，是康熙為進一步籠絡漢族士大夫的又一重要舉措。
博學鴻儒科又稱博學宏詞科，本是唐宋時期科舉考試的一種形式，因是在進士及第者中選拔淵博能文之士，要求極高，考取極難，故未能普及推廣。元明清時期，科舉仍以進士科為主，並專以八股文取士。這種形式在明清之際受到懷念明朝、拒絕效忠清朝的名節之士的冷落。盡管康熙曾一再利用薦舉的方式敦請他們出仕任職，卻收效甚微，不得不考慮采取特殊方式。