胡林翼的話很明白，湘軍水師行將分裂，湘軍水、陸將領非曾國藩難以指揮自如。他在奏疏的結論中提出：若許曾國藩“移孝作忠”，視師九江，即日督帶湘軍水陸師會合楚軍，將士一心，不難攻占九江，水陸東征安徽，直搗金陵。但清政府卻批複說：“克敵製勝之策，該署撫與官文、都興阿、楊載福（即楊嶽斌）等盡可商辦，正不必待曾國藩到楚方能定議。”清政府對曾國藩的猜忌已深，斷然拒絕了胡林翼的請求。
李秀成擊敗江南大營後，曾國藩終於有機會出山了。因為八旗兵已不可用。同時，曾國藩、胡林翼並對清政府關於東南的人事布局做了一番揣測。胡林翼說：“江、浙為倉廩根本，京師性命所係，然使泛泛以尋常辦理軍務之人前往，即事權不屬，功必不成。近十日中，必有十餘人奏請滌帥往援。林翼之意，必得地方之符乃可去，非此則不可去也。設滌帥去後，秋冬之間，賊必有三四十萬大股並力西犯。”後來，曾國藩聽說忠王李秀成略定蘇常，驚呼：“蘇常失守，杭州亦岌岌可危，東南大局決裂如此，不知尚有何術可以挽回……現奉寄諭，飭國藩往援蘇、常，蓋不知蘇、常已失也。鄙意楚軍刻不能救援下遊，且當竭三省全力，禦賊匪秋間之大舉，如能於秋間兩路大捷，然後有餘力兼謀下遊，目前實有不逮。”同時他對自己的出路，也做了一番猜測。他說：蘇、常失守，“目下浙江危急之至……東南大局，一旦瓦裂，皖北各軍，必有分援江、浙之命，非胡潤帥移督兩江，即餘往視師蘇州。二者苟有其一”，則進攻安徽的軍事布局，不能不有所變更。“餘則聽天由命，或皖北，或江南，無所不可。”曾國藩、胡林翼迫切希望他們兩人中能有一人出任兩江總督，以擴大湘係地盤。