同治皇帝的葬禮過去後，其金棺槨也選擇良辰吉日安放了，至於他將來子嗣的問題，也伴隨著吳可讀事件進行了解釋和允諾。這樣一來，國家局麵漸漸平靜下來，兩宮皇太後依然按照之前的慣例垂簾聽政。很快，光緒皇帝漸漸長大了，而且和慈安的關係非常好，當時的宮裏人都感覺到了。究其原因，無外乎慈安太後性情溫和，不似西太後那樣冷麵嚴肅，所以小皇帝才敬愛慈安太後。光緒小時候活潑好動，時常跑到東宮去玩耍，不和西太後接近，此舉讓西太後心情不爽，感覺小皇帝內心傾向慈安太後，心裏難以承受，並且，此時有人在西太後耳邊進讒言，說慈安太後暗地蠱惑小皇帝反對西太後。這樣一來，兩宮皇太後之間的隔閡不斷加大。
西太後對小皇帝和慈安太後親近感到惱火，還擔心慈安如此一來會得到皇帝的喜歡，因此，西太後嚴密監視著小皇帝的一舉一動。西太後非常清楚慈安的性情，了解她並非自己的對手，可真要聯合皇帝的話，就會蠱惑皇帝跟自己作對，那麽自己的處境就危險了。隨著皇帝的漸漸長大，西太後的防備心理也不斷加深。之前，乾隆皇帝曾經有個妃子非常奢侈，並且還喜好遊玩，結果遭到了母後的冷落，到後來被賜死。西太後非常擔心自己將來也遭遇這樣的下場，所以才加強戒備。後來發生了一件事，導致兩宮皇太後之間發生了很大的爭執。光緒六年（1880），兩宮皇太後去東陵祭祀，當時皇帝剛剛九歲。恭親王認為，慈安皇後應該在西太後前麵進入祭祀，慈安也是這樣的想法，因此兩人在鹹豐皇帝的靈柩前開始了激烈的爭吵。慈安認為，西太後在鹹豐皇帝在世時隻是一名嬪妃，到鹹豐皇帝駕崩之後才升級成為了太後。既然身為嬪妃，那祭祀時理所當然排在自己後麵。慈安還準備將左邊更加尊貴的位置留給已經過世的鹹豐皇後。鹹豐皇後盡管去世在鹹豐駕崩之前，可在名義上依然是鹹豐皇帝的正牌皇後。西太後感覺此事肯定是恭親王挑撥，所以堅決不退讓。最終，祭祀依然按照西太後的想法進行。這次在祖宗陵墓前，當著眾大臣的麵發生爭執，西太後感覺非常有失大體，並且也是對先人的詆毀和不尊重。此事非常明顯是有預謀的，所以對慈安太後更加抵觸。（到皇陵來祭祀的活動中，此類爭執事件經常發生，這能夠引起人們的注意。其實，後宮婦女長時間在宮內，倍受壓抑，往往都會借此機會發泄。宣統元年即1909年時，同治、光緒的嬪妃和隆裕太後也是因西太後的安葬爆發了巨大爭執，以至於不肯回宮，準備永遠留在陵墓，最終在王公大臣的勸說下才回京。）