西太後剛剛執政的時候比較溫和，還能聽從恭親王的勸告，聯合慈安太後任命恭親王擔任攝政王職務，並下令，攝政王世世代代能夠沿襲王位。恭親王極力回絕這次任命，兩宮皇太後就極力堅持，最終在恭親王再三懇求下，兩宮皇太後收回了任命。其實，有兩宮皇太後輔政，根本用不著其他人再來輔佐。西太後一直掛念著恭親王在熱河曾經協助自己的大恩，就加封恭親王女兒為大公主，還特許可以用黃色轎子，所以恭親王一度權勢很大。在西太後開始執政時，因為許多事情還比較生疏，且北京城裏派別林立難以掌控，又不擅長外交事務，擔心局麵不好控製，所以恭親王就成為了西太後的親信。恭親王攝政時間比較長，曆經很多大事，猶如西太後的左膀右臂。時間一長，西太後漸漸熟悉了朝中的國家大事處理方法，剛毅的性情漸漸顯露出來，她不喜歡別人幹涉自己的事情。西太後非常聰慧，加之博覽群書，在用人做事方麵非常得民心。對之前信任的大臣，慢慢開始疏遠，西太後開始獨攬朝政。
西太後性情本來如此，可恭親王本身不甘心退居幕後，其性情野心和西太後難分上下。西太後慢慢對恭親王開始疏遠冷遇，恭親王漸漸感覺到難以容忍，所以，二人的關係再也不像之前那樣親密了。接下來，西太後就鼓勵慈安遇到一點事情就給恭親王“小鞋子”穿，和諧相處的境況難以恢複到從前。恭親王在用人時，無論升遷還是罷免，都不會和西太後商議，自己一人決定。各個省份的大事，恭親王都一人操作。後宮和朝堂之間的矛盾慢慢滋生起來，開始互相掣肘。
當時，人們都感覺恭親王如此對待兩宮皇太後有些過分。恭親王感覺自己已經掌握了大權，開始操控所有，驕橫是難免的。
西太後在一次召見恭親王時，恭親王居然對她們說：你們之所以有今天的地位，都是因為有我。西太後絕對不會容忍這樣的話。西太後召見大臣的時候，都會坐到大殿的寶座上，麵前還要隔著黃色的簾子，被召見的人是不會看到太後的。召見時，人要分開進入。恭親王借助議政的理由，時常先進朝堂。寶座周圍就有殿前的宦官，出現大臣失態，宦官都能看到。沒有總管宣旨，無論什麽人都不能擅自進入。但是，恭親王多次沒等宦官們宣旨就直接進入大內，感覺自己能夠超越這些宮禁製度。