王文韶取代翁同龢出任軍機大臣和戶部尚書，使政府改組基本告一段落，剩下的事情就是怎樣具體推動改革。政府要想真正推動維新變法向縱深發展，就必須盡快理清思路，確定改革的重點與難點，以及應該守住怎樣的政策底線，哪些方麵是根本不可觸動的。
一 召見政治新銳
6月16日，光緒皇帝按照原先的日程安排，召見康有為。這既是康有為畢生第一次見到光緒皇帝，也是其一生中唯一的一次。可是這次會見給康有為留下了很深的印象，他在後來的歲月裏不斷加以炫耀，反複強調這次召見的重大意義。
是日清晨，康有為在東宮門內朝房等候光緒皇帝的召見時，遇見已獲任命的直隸總督榮祿也在等候麵見皇上，要表示謝恩。榮祿問康有為：“以子槃槃大才，亦將有補救時局之術否？”康有為答道：“非變法不可。”榮祿接著問道：“固知法當變也，但一二百年之成法，一旦能遽變乎？”康有為直截了當地告訴榮祿：“殺二品以上阻撓新法大臣，則新法行矣。”
康有為在朝房內的短暫談話給榮祿留下非常不好的印象，由此不僅注定了康有為無法獲得光緒皇帝重用的機會，也為後來的一係列變故留下了重要的伏筆。榮祿與康有為對話結束後迅即入見光緒皇帝，他在與光緒皇帝談完自己的事情之後，有意無意地試探光緒皇帝覺得康有為這個人怎麽樣？光緒皇帝尚未見到康有為本人，他隻能從已經看過的康有為文章、著作，以及翁同龢的談話、匯報及最近期的徐致靖的推薦書中判斷康有為“以為能也”。榮祿明顯感到皇上似乎有重用康有為的意思。
榮祿隨後即到慈禧太後處謝恩。時李鴻章“放居”賢良寺，為謝慈禧太後賞食物，也正在皇太後處。榮祿將剛剛在光緒皇帝那裏所說的話告訴了慈禧太後，表示康有為的激進辦法並不可取，皇上如果過於聽信康有為的主張，必將危害大清王朝的根本利益。他甚至恭維在場的李鴻章“多曆事故，宜為皇太後言之”。老資格的政治家李鴻章既看不慣接替自己多年前曾經擔任過的直隸總督職務的“新科”官僚飛揚跋扈、不可一世的姿態，再加上他正在韜光養晦，也不願在自己尚未弄清真相的時候陷入被動。於是當他聽到榮祿讓他向太後詳談的建議後，嚇得“麵色大變”，趕緊叩頭，稱“皇太後聖明”，一切由皇太後做主。榮祿的本意是“暗請太後留神”，在適當的時候能夠阻止光緒皇帝一意孤行，過於聽信和過於重用康有為。而慈禧太後則歎息道：“兒子大了，哪裏認得娘？其實我不管倒好，汝作總督，憑曉得的做罷。”顯然，慈禧太後並不願意在榮祿、李鴻章等人麵前表現出自己有意幹預正在積極推動變法新政的光緒皇帝。