從鴉片戰爭到義和團運動期間發生大小教案有400起。鴉片戰爭後第一次有影響的教案是1848年3月發生在江蘇青浦縣的“青浦教案”。這次教案係因英國傳教士麥都思、雒魏林、慕維廉三人非法潛入青浦縣傳教，並毆打中國水手而引起。中國水手複將麥都思等打傷，青浦知縣即派人護送麥都思等回上海。英國駐上海領事阿禮國蓄意擴大事態，令英船停付關稅，並派軍艦封鎖吳淞口。英副領事羅伯遜乘軍艦到南京要挾兩江總督李星沅。結果蘇鬆太道鹹齡被撤職，10名水手被捕戴枷示眾（其中2名被判徒刑），另賠銀300兩。
從19世紀60年代起至19世紀末，隨著列強對華侵略、滲透的進一步加深，教案發展演變大體有三個多發期。每一個多發期都是以列強發動大規模侵華戰爭、強迫中國簽訂不平等條約為起點。第一個多發期是在第二次鴉片戰爭及《北京條約》的簽訂後的10餘年內，外國駐京公使可以直接幹涉中國內政，外國人可以到內地遊曆、通商和傳教，使民教衝突的事件也急劇增多，且頻繁發生。第二個多發期集中在邊疆危機和中法戰爭前後，這一時期列強在采用軍事、政治手段侵略中國西南邊陲、東南沿海地區以及長江流域的同時，也特別重視在這些地區大力擴展傳教事業，法國尤其如此。這一時期的教案大多發生在這些地區也與此密切相關。第三個多發期集中在甲午戰爭後幾年內，列強競相在中國劃分勢力範圍，中國麵臨空前的民族危機，與此相應，教案亦愈演愈烈。在這三個時期中，教案發生日益頻繁，次數日益集中，表明隨著每一次侵華戰爭後列強對中國的侵略和滲透的進一步擴大，與列強炮艦政策相配合的傳教事業，自然也隨之拓展其在華的勢力和影響，中國民眾的反教鬥爭也以此為起點，一步步走向**。