2002年10月2日，不起眼的伊利諾斯州州參議員巴拉克·奧巴馬在芝加哥的聯邦廣場上發表了反伊拉克戰爭演講。“我並不反對所有戰爭，”他告訴聽眾，“我反對愚蠢的戰爭。”八天之後，全球知名的前美國第一夫人在美國參議院的發言台上發表了講話。白宮當時正在處理一項可怕的事件：據說，薩達姆·侯賽因在秘密研製化學、生物和核武器。總統希望國會支持他采取軍事行動，對薩達姆進行打擊。“這是曾經做過的決定裏最難的一個，”希拉裏·克林頓苦笑著說道，“每一次可能引起戰爭的投票都是艱難的抉擇。但是我堅信這是正確的選擇。”帶著這樣的想法，她認可了喬治·W·布什的入侵計劃。
伊拉克戰爭應該是最能體現希拉裏和奧巴馬之間深層斷裂線的事件。這個事件對兩個人來說都是決定性因素，其中一人還因此影響了餘生，甚至在2016年參選之時也深受影響。這一事件推動或阻礙了他們的雄心壯誌，引導他們做出許多決定，並決定了他們如何感知美國在遠方衝突上所扮演的角色。奧巴馬的外交政策有時很極端，會極力地否定布什在軍事活動上的失誤。2015年夏天，他抨擊了那些反對他和伊朗核協議的人，指責這些人就跟過去那些讓美國陷入伊拉克陷阱的人一樣昏聵糊塗。2011年12月，他下令從巴格達撤離了最後一名美國軍人，完成了珍貴的競選諾言。但“伊斯蘭國”極端宗教武裝分子在美國軍隊撤離後，橫掃了敘利亞邊境的安全真空區，證明了美國撤軍隻是奧巴馬一次有名無實的勝利。就這樣，奧巴馬被迫將士兵送回伊拉克，給他的繼任者留下了一個未完成的危險事業。
希拉裏與喬·拜登和約翰·克裏曾就投票授權戰爭上進行了激烈爭論，最終改變了參議院其他人的判斷。她堅持認為：白宮誤導了她，讓她以為白宮會在戰火拉響之前奮守最後一道外交防線。她與當時還是參議員的奧巴馬一起抨擊了布什政府的戰爭行為，反對了其2007年的軍隊擴張計劃。後來，她承認，自己采取這一立場一部分是出於政治原因，另一個原因則是戰爭不受歡迎。