當文強一行視察回到屯溪忠義救國軍總部時，得知總部發生了一起“反革命組織”案件。但他不知其詳。
此前，戴笠曾向他探問過，說是有人告發劉人奎與中共方麵有往來，他為劉人奎作了辯護，勸戴笠說，國共合作抗日時期，用人不疑，疑人不用。戴笠也就未再追問。
據劉人奎在30多年後回憶，此案由忠義救國軍總部參謀處破獲，抓了兩人，一個是名叫張也的參謀，判了15年徒刑；另一個是姓李的政工隊（即文工隊）女兵，人稱李大姐，被判了死刑。
劉人奎回憶說：“我和別的進步分子，李大姐、張也等，在屯溪聯絡過新四軍，組織過‘抗日同誌會’，但不久便被破獲了。”“實際那個組織——抗日同誌會，是我們三人搞的，因為我先兩個月離開了屯溪，未牽連進去。文強那時很為我擔心，但我始終沒有告訴他，我也是其中的一個。”
由於抗戰初期國共合作共同對敵的大氣候，也由於俞作柏、文強與張雲逸、袁國平間良好的私人關係，忠義救國軍與新四軍這兩支活躍在江南的抗日部隊，那時雖有摩擦，但並未像後來那樣形同水火。
到俞作柏與文強先後被調離忠義救國軍總部後，國民黨方麵的反共頑固派活動也日益發展，以後這兩支部隊的關係也就日益惡化，內戰不斷。形成令人痛心的局麵。
不過，當時並不隻是在國民黨軍與新四軍之間有摩擦內戰，在忠義救國軍內部也一樣有過內戰，如丁錫山領導的忠義救國軍八支隊（駐浦東）就與南匯縣長於陶生領導的四支隊、川沙縣長李子明領導的三支隊發生過火並。因忠義救國軍是原別動隊改編而成，這種內戰便被當地群眾譏為“別吃別（鱉吃鱉）”。
此外，在忠義救國軍與第三戰區顧祝同領導的國民黨正規軍之間，也矛盾重重，一度鬧到蔣介石想要撤銷忠義救國軍的地步，後來是與戴笠關係密切的胡宗南從中斡旋，將其部下親信師長馬誌超派去接替了周偉龍的忠義救國軍總指揮職務，才平息了這一風波。