杜勒斯並不急於到投降的德國赴任。他先是休假一周，跟蓋沃尼茲一起寫“日出行動”報告，之後，他托瑪麗·班克羅夫特照顧克洛弗和女兒瓊，自己飛到華盛頓與多諾萬會麵，然後到紐約和沙利文-克倫威爾律師事務所與合作夥伴會麵協商。旅途中，痛風一直在困擾著他。律師事務所從7月1日停發了他的工資，所以杜勒斯開始從戰略情報局領取薪水，每月850美元。在德國工作期間，他把其中的一部分寄給了仍在伯爾尼的妻子克洛弗和女兒瓊。
在他返回歐洲在倫敦逗留時，英國人把他奉為座上賓，讓他享受了皇家待遇，帶他私下拜會了丘吉爾，並為他舉辦了答謝晚宴。1945年7月6日，他把伯爾尼站和紳士街的公寓移交給了羅伯特·喬伊斯，一個耶魯大學畢業的駐外事務處官員，曾在戰略情報局參加巴爾幹地區的行動。第二天，杜勒斯穿一件寬鬆無徽章的陸軍軍裝，飛到了德國的威斯巴登。多諾萬申請讓他做一名職位與將軍相同的文官，因為他現在從事的是將軍級別的工作。他的特派團不僅要監督戰略情報局在德國的情報工作，同時也要兼顧奧地利、捷克斯洛伐克和瑞士。五角大樓一直推諉，但還是同意了讓他住在將軍級別的住處。
杜勒斯依然還在競爭對手的監視之下。一個在多諾萬背後建立的名叫“池塘”的軍事間諜組織的間諜，向他們的領導約翰·格朗貝克匯報，稱杜勒斯計劃利用政府部門的飛機，每月三次去探望他在伯爾尼的家屬。同時，戰略情報局有流言說，多諾萬把杜勒斯弄到威斯巴登是怕他礙手礙腳。如果是這樣的話，這個計劃將是白費心機。杜勒斯認為待在被納粹攪得亂七八糟的德國並非長久之計。
他到達威斯巴登時，美國有300多萬人的部隊在歐洲，其中160萬人在按照2月份雅爾塔會議中劃分的地盤與蘇聯、英國和法國軍隊在德國占領區。繳槍投降的德國士兵大約有1100萬人。暴力事件並沒有在歐戰勝利日終結。在5月8日投降後，大部分飽受戰爭**的歐洲地區陷入了無政府狀態，機構被摧毀、政府流亡、邊界解散、銀行關閉、法律和秩序缺失。整個大陸的生活仿佛回到了中世紀，1700個蘇聯城市和鄉鎮被毀，三分之一的希臘森林消失，上千年的波蘭建築被一掃而光，德國隻有2%的工業生產能力尚存，4000萬人死去，其中2700萬是蘇聯人，歐洲繁榮的地帶現在人煙稀少。